RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
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PTPRM-204ENST00000577468 MRAPQ8TCY5 172 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF480Q8WV37 535 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 C11orf40Q8WZ69 217 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 ST8SIA1Q92185 356 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 LHX4Q969G2 390 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP2.8□□□□□ -1.96
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PTPRM-204ENST00000577468 COQ2Q96H96 371 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM56Q96MV1 263 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 ERGIC2Q96RQ1 377 aa2.8□□□□□ -1.96
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PTPRM-204ENST00000577468 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
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PTPRM-204ENST00000577468 ZNF426Q9BUY5 554 aa2.8□□□□□ -1.96
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PTPRM-204ENST00000577468 NEUROG2Q9H2A3 272 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa2.8□□□□□ -1.96
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PTPRM-204ENST00000577468 CUTCQ9NTM9 273 aa2.8□□□□□ -1.96
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PTPRM-204ENST00000577468 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa2.79□□□□□ -1.96
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PTPRM-204ENST00000577468 GLSO94925 669 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 AP2A2O94973 939 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 SCELO95171 688 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 UTS2O95399 124 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 ETHE1O95571 254 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 TSPAN12O95859 305 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 TXNDC12O95881 172 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 CST1P01037 141 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 GH2P01242 217 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 VIPP01282 170 aa2.79□□□□□ -1.96
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