RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566452.1

BBS2-215, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 2

Gene BBS2, Length 299 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-215	ENST00000566452	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		3.13	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	NPTN	Q9Y639	398 aa		3.13	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	DMD	P11532	3685 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452		A0A1B0GVL5	298 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	BTBD17	A6NE02	478 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	RNF212B	A8MTL3	300 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	HHLA1	C9JL84	531 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	FBP2	O00757	339 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	MSH4	O15457	936 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	RNF13	O43567	381 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	FGF17	O60258	216 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	UPK3A	O75631	287 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	PDE5A	O76074	875 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	SLITRK3	O94933	977 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	CRYAA	P02489	173 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	KRT6A	P02538	564 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	PRSS1	P07477	247 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	STAG3L3	P0CL85	134 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	ACADS	P16219	412 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	AOC1	P19801	751 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	UCP1	P25874	307 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	SAA4	P35542	130 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	SLC7A2	P52569	658 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	EFNB2	P52799	333 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	ERVK-16	P61578	105 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	DHODH	Q02127	395 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	BDH1	Q02338	343 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	SFT2D3	Q587I9	215 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	HOGA1	Q86XE5	327 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	PEX13	Q92968	403 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	BIRC7	Q96CA5	298 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	C12orf66	Q96MD2	445 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	ZNF639	Q9UID6	485 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	RASD1	Q9Y272	281 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	NUP205	Q92621	2012 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	WDR81	Q562E7	1941 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	EML5	Q05BV3	1969 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452		A0A087WW49	117 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	FAM172BP	A6NC97	362 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	ERICH4	A6NGS2	130 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452		K7EQD1	137 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	TAPBP	O15533	448 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	RAMP1	O60894	148 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	CDH16	O75309	829 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	CIAO1	O76071	339 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	CLDN9	O95484	217 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	CRYGB	P07316	175 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	RALB	P11234	206 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	NDST2	P52849	883 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	RGS1	Q08116	209 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	IFT88	Q13099	833 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	TMEM187	Q14656	261 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	RAB35	Q15286	201 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BBS2-215	ENST00000566452	CD226	Q15762	336 aa		3.11	□□□□□ -1.91

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