RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564718.1

E2F4-204, Transcript of E2F transcription factor 4, human

TSL 3

Gene E2F4, Length 688 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
E2F4-204	ENST00000564718	H3F3A	P84243	136 aa		11.16	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	MAPK11	Q15759	364 aa		11.16	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	SYPL1	Q16563	259 aa		11.16	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	GPAT3	Q53EU6	434 aa		11.16	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	HHAT	Q5VTY9	493 aa		11.16	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		11.16	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	GRINA	Q7Z429	371 aa		11.16	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		11.16	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	OR52E6	Q96RD3	313 aa		11.16	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	PANX1	Q96RD7	426 aa		11.16	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	NGB	Q9NPG2	151 aa		11.16	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		11.16	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	LIPT1	Q9Y234	373 aa		11.16	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		11.16	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		11.15	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	TMEM120B	A0PK00	339 aa		11.15	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		11.15	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		11.15	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	AP3D1	O14617	1153 aa		11.15	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	LYZL6	O75951	148 aa		11.15	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	PMS2P2	O95744	297 aa		11.15	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	GSN	P06396	782 aa		11.15	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	CD3E	P07766	207 aa		11.15	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	CHRM4	P08173	479 aa		11.15	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	SOD3	P08294	240 aa		11.15	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	TFPI	P10646	304 aa		11.15	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	COX5A	P20674	150 aa		11.15	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	MVD	P53602	400 aa		11.15	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	COX20	Q5RI15	118 aa		11.15	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		11.15	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		11.15	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	CMIP	Q8IY22	773 aa		11.15	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		11.15	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		11.15	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	ZNF563	Q8TA94	476 aa		11.15	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	PMM1	Q92871	262 aa		11.15	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	NEUROG1	Q92886	237 aa		11.15	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		11.15	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		11.15	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		11.15	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		11.15	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		11.15	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		11.15	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		11.15	□□□□□ -0.62
E2F4-204	ENST00000564718	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		11.14	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		11.14	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	FAAH	O00519	579 aa		11.14	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	CLOCK	O15516	846 aa		11.14	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	DNPH1	O43598	174 aa		11.14	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	RAMP1	O60894	148 aa		11.14	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	THBS1	P07996	1170 aa		11.14	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	SLC16A1	P53985	500 aa		11.14	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	BSPH1	Q075Z2	132 aa		11.14	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		11.14	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		11.14	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		11.14	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	MAVS	Q7Z434	540 aa		11.14	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		11.14	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	CCDC103	Q8IW40	242 aa		11.14	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		11.14	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		11.14	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	TRIM2	Q9C040	744 aa		11.14	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	ADAM19	Q9H013	955 aa		11.14	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		11.14	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	PLCE1	Q9P212	2302 aa		11.14	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		11.13	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	OR5H1	A6NKK0	313 aa		11.13	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		11.13	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	ZNF208	O43345	1280 aa		11.13	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	SLC22A3	O75751	556 aa		11.13	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	CD8A	P01732	235 aa		11.13	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	IL6	P05231	212 aa		11.13	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	TFPT	P0C1Z6	253 aa		11.13	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	KIT	P10721	976 aa		11.13	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	IMPDH2	P12268	514 aa		11.13	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	CCNA2	P20248	432 aa		11.13	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	SLC1A3	P43003	542 aa		11.13	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	MAGEA8	P43361	318 aa		11.13	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	HTR3A	P46098	478 aa		11.13	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	MAP2K6	P52564	334 aa		11.13	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	ATP5J2	P56134	94 aa		11.13	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	PGGHG	Q32M88	737 aa		11.13	□□□□□ -0.63
E2F4-204	ENST00000564718	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		11.13	□□□□□ -0.63

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