RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563386.5

USP10-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, humanhuman

TSL 4

Gene USP10, Length 590 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP10-208ENST00000563386 EPXP11678 715 aa16.87■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 GPX2P18283 190 aa16.87■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 SLC6A2P23975 617 aa16.87■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 AQP1P29972 269 aa16.87■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 AGTR1P30556 359 aa16.87■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 OR2B6P58173 313 aa16.87■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 MTPNP58546 118 aa16.87■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 COPZ1P61923 177 aa16.87■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 SELPLGQ14242 412 aa16.87■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 CYP51A1Q16850 503 aa16.87■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 RNF220Q5VTB9 566 aa16.87■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 TMPPEQ6ZT21 453 aa16.87■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 ZNF550Q7Z398 422 aa16.87■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 KRT73Q86Y46 540 aa16.87■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 TUSC5Q8IXB3 177 aa16.87■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 TSPEARQ8WU66 669 aa16.87■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 ARL5BQ96KC2 179 aa16.87■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa16.87■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 NDRG3Q9UGV2 375 aa16.87■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 CREBBPQ92793 2442 aa16.86■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 TMEM72A0PK05 275 aa16.86■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 SH3D21A4FU49 640 aa16.86■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 A6NNC1 897 aa16.86■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 CXCR1P25024 350 aa16.86■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 HOXC5Q00444 222 aa16.86■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 KLF10Q13118 480 aa16.86■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 ZSWIM7Q19AV6 140 aa16.86■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 MMEL1Q495T6 779 aa16.86■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 ANKRD34AQ69YU3 496 aa16.86■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 SERPINA11Q86U17 422 aa16.86■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 SLC43A2Q8N370 569 aa16.86■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 DDIT4LQ96D03 193 aa16.86■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 ANKRD27Q96NW4 1050 aa16.86■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 SAR1AQ9NR31 198 aa16.86■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 ELOVL5Q9NYP7 299 aa16.86■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 KLHL14Q9P2G3 628 aa16.86■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 KLHL13Q9P2N7 655 aa16.86■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 CHST2Q9Y4C5 530 aa16.86■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 FAAHO00519 579 aa16.85■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 FBP2O00757 339 aa16.85■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 CASKO14936 926 aa16.85■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 CTAG2O75638 210 aa16.85■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 YES1P07947 543 aa16.85■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 ETS2P15036 469 aa16.85■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa16.85■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 ADRM1Q16186 407 aa16.85■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 WBP2NLQ6ICG8 309 aa16.85■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 STK32CQ86UX6 486 aa16.85■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa16.85■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa16.85■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 PIF1Q9H611 641 aa16.85■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 TMEM38AQ9H6F2 299 aa16.85■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 KLHL28Q9NXS3 571 aa16.85■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa16.85■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 GMEB1Q9Y692 573 aa16.85■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 PDZD2O15018 2839 aa16.84■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 LOC100653049A0A140TA62 436 aa16.84■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 C16orf97H3BN30 126 aa16.84■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 KRT34O76011 436 aa16.84■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 UGT2B10P36537 528 aa16.84■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 CLK1P49759 484 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 BNIP2Q12982 314 aa16.84■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 CDH24Q86UP0 819 aa16.84■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 SNX32Q86XE0 403 aa16.84■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 HIPK4Q8NE63 616 aa16.84■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 NRGNQ92686 78 aa16.84■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 DACH2Q96NX9 599 aa16.84■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa16.84■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 ZNF607Q96SK3 696 aa16.84■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 MED18Q9BUE0 208 aa16.84■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 ADAM19Q9H013 955 aa16.84■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 MRGBPQ9NV56 204 aa16.84■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 KLHL9Q9P2J3 617 aa16.84■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 ANGPT4Q9Y264 503 aa16.84■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa16.84■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 MYO9AB2RTY4 2548 aa16.84■□□□□ 0.29
USP10-208ENST00000563386 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
USP10-208ENST00000563386 MRASO14807 208 aa16.83■□□□□ 0.28
USP10-208ENST00000563386 TPST1O60507 370 aa16.83■□□□□ 0.28
USP10-208ENST00000563386 CYTIPO60759 359 aa16.83■□□□□ 0.28
USP10-208ENST00000563386 MPDZO75970 2070 aa16.83■□□□□ 0.28
USP10-208ENST00000563386 PMS2P2O95744 297 aa16.83■□□□□ 0.28
USP10-208ENST00000563386 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
USP10-208ENST00000563386 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
USP10-208ENST00000563386 POU4F3Q15319 338 aa16.83■□□□□ 0.28
USP10-208ENST00000563386 MAPRE2Q15555 327 aa16.83■□□□□ 0.28
USP10-208ENST00000563386 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
USP10-208ENST00000563386 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
USP10-208ENST00000563386 PTOV1Q86YD1 416 aa16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.7 ms