RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561436.1

HERC1-215, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, humanhuman

TSL 4

Gene HERC1, Length 551 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1-215ENST00000561436 WDR88Q6ZMY6 472 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-215ENST00000561436 Q6ZSR6 202 aa3.06□□□□□ -1.92
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HERC1-215ENST00000561436 BNIPLQ7Z465 357 aa3.06□□□□□ -1.92
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HERC1-215ENST00000561436 VPS36Q86VN1 386 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-215ENST00000561436 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-215ENST00000561436 FANCMQ8IYD8 2048 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-215ENST00000561436 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa3.06□□□□□ -1.92
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HERC1-215ENST00000561436 TMEM37Q8WXS4 190 aa3.06□□□□□ -1.92
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HERC1-215ENST00000561436 SEC14L4Q9UDX3 406 aa3.06□□□□□ -1.92
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HERC1-215ENST00000561436 LRRN3Q9H3W5 708 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC1-215ENST00000561436 TUBB1Q9H4B7 451 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC1-215ENST00000561436 JPT2Q9H910 190 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC1-215ENST00000561436 POPDC2Q9HBU9 364 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC1-215ENST00000561436 SLC25A19Q9HC21 320 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC1-215ENST00000561436 IL1RAPQ9NPH3 570 aa3.05□□□□□ -1.92
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