RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561405.1

UBE2CP4-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene UBE2CP4, Length 535 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CP4-201ENST00000561405 CRYGSP22914 178 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 LOXP28300 417 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 CPOXP36551 454 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 HTR3AP46098 478 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 CLK1P49759 484 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 CCR4P51679 360 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 MAP2K6P52564 334 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 IST1P53990 364 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 CRISP3P54108 245 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 AQP5P55064 265 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 CTBP2P56545 445 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 DSTNP60981 165 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 STX1BP61266 288 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 MERTKQ12866 999 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 EPS8Q12929 822 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 FADDQ13158 208 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 PDK3Q15120 406 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 RGNQ15493 299 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZSWIM7Q19AV6 140 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 SYT14P1Q58G82 188 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 RNF220Q5VTB9 566 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 SLC2A7Q6PXP3 512 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 TFAP2EQ6VUC0 442 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 STAC2Q6ZMT1 411 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 TMPPEQ6ZT21 453 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 BEND4Q6ZU67 534 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 C22orf34Q6ZV56 151 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 ADGRG3Q86Y34 549 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZNF440Q8IYI8 595 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 RFWD2Q8NHY2 731 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 ABHD3Q8WU67 409 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 SLC38A5Q8WUX1 472 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 WDR60Q8WVS4 1066 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 NRGNQ92686 78 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 SLC35B4Q969S0 331 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 MBD6Q96DN6 1003 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 FOXC2Q99958 501 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 PSD2Q9BQI7 771 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 ADAM19Q9H013 955 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 LIME1Q9H400 295 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZNF385DQ9H6B1 395 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 BCL2L10Q9HD36 194 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 A4GALTQ9NPC4 353 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 CTPS2Q9NRF8 586 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 SERINC1Q9NRX5 453 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 KLHL13Q9P2N7 655 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 CHRNA9Q9UGM1 479 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 CLEC4AQ9UMR7 237 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 CHST2Q9Y4C5 530 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 DSCAMO60469 2012 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa6.59□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 A0A0G2JPF8 293 aa6.59□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 CFAP73A6NFT4 308 aa6.59□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZNF724A8MTY0 619 aa6.59□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa6.59□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa6.59□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 CLIC1O00299 241 aa6.59□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 CASKO14936 926 aa6.59□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZNF208O43345 1280 aa6.59□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 EDF1O60869 148 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 PRKD3O94806 890 aa6.59□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 ANP32DO95626 131 aa6.59□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 PMS2P2O95744 297 aa6.59□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 PLGP00747 810 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 YES1P07947 543 aa6.59□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa6.59□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 CD1EP15812 388 aa6.59□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 IL7RP16871 459 aa6.59□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 SLC7A1P30825 629 aa6.59□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 SLC1A3P43003 542 aa6.59□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 CRATP43155 626 aa6.59□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 IDH2P48735 452 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 DIO1P49895 249 aa6.59□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 H3F3AP84243 136 aa6.59□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 GNA13Q14344 377 aa6.59□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 SQLEQ14534 574 aa6.59□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 LIN52Q52LA3 116 aa6.59□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 PAGE3Q5JUK9 113 aa6.59□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.59□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 C6orf10Q5SRN2 563 aa6.59□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 ALKBH2Q6NS38 261 aa6.59□□□□□ -1.35
UBE2CP4-201ENST00000561405 PAMR1Q6UXH9 720 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms