RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560576.1

TMOD2-204, Transcript of tropomodulin 2, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD2, Length 2,348 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2-204ENST00000560576 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 TRAF6Q9Y4K3 522 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 VWC2LB2RUY7 222 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 COPEO14579 308 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 STX11O75558 287 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 PGRP06401 933 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 ITGA5P08648 1049 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 MATN1P21941 496 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 NR4A2P43354 598 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 CLK1P49759 484 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 SLC16A1P53985 500 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 OR2B6P58173 313 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 CASP12Q6UXS9 341 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 IFT20Q8IY31 132 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 WDR31Q8NA23 367 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 OR5D16Q8NGK9 328 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 OR5AK3PQ8NH89 298 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 ZNF563Q8TA94 476 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 TWIST2Q8WVJ9 160 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 OIT3Q8WWZ8 545 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 SLC35G5Q96KT7 338 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 CTPS2Q9NRF8 586 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 PARPBPQ9NWS1 579 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 SLC35F4A4IF30 521 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 PIP5K1BO14986 540 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 TRIM13O60858 407 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 WNT11O96014 354 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 FGF4P08620 206 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 PRPS1P60891 318 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 TGFBR3Q03167 851 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 KLHL24Q6TFL4 600 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 C16orf62Q7Z3J2 963 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 C10orf107Q8IVU9 208 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 OR52E4Q8NGH9 312 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 COQ8BQ96D53 544 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 FBXO17Q96EF6 278 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 DUSP26Q9BV47 211 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 EXD2Q9NVH0 621 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 CHRNA9Q9UGM1 479 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 NPHS1O60500 1241 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 PEX11AO75192 247 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 UGT2B17O75795 530 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 LY6HO94772 140 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 PRPS1L1P21108 318 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 PCLAFQ15004 111 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 CARTPTQ16568 116 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 FAM153CQ494X1 144 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 IQCCQ4KMZ1 466 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 ATAD3BQ5T9A4 648 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 C9orf135Q5VTT2 229 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 GRINAQ7Z429 371 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 C6orf120Q7Z4R8 191 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 C3orf49Q96BT1 292 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 SORCS2Q96PQ0 1159 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 KCNS3Q9BQ31 491 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 CCDC106Q9BWC9 280 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 PRR14Q9BWN1 585 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 ZNF350Q9GZX5 532 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 POLE3Q9NRF9 147 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 TMEM181Q9P2C4 612 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 KCNE5Q9UJ90 142 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 MKLN1Q9UL63 735 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 TRAPPC4Q9Y296 219 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 ALPK2Q86TB3 2170 aa6.59□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa6.59□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 PDLIM1O00151 329 aa6.59□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 KIAA0513O60268 411 aa6.59□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 AGR2O95994 175 aa6.59□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 GUSBP08236 651 aa6.59□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 MPGP29372 298 aa6.59□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 PGM1P36871 562 aa6.59□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 HTR3AP46098 478 aa6.59□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 RPS26P62854 115 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 SLC35A1P78382 337 aa6.59□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 PTGR1Q14914 329 aa6.59□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.59□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 IL23RQ5VWK5 629 aa6.59□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa6.59□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 RFLNBQ8N5W9 214 aa6.59□□□□□ -1.35
TMOD2-204ENST00000560576 FAM71CQ8NEG0 241 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.5 ms