RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549306.1

HECTD4-210, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 2

Gene HECTD4, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-210ENST00000549306 TCF4P15884 667 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 TNNI3P19429 210 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 KDELR1P24390 212 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 HMGCLP35914 325 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 GP5P40197 560 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 NNMTP40261 264 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 BRCC3P46736 316 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 GSSP48637 474 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 PLXNA3P51805 1871 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 TNFRSF17Q02223 184 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 CAV1Q03135 178 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 GLO1Q04760 184 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 CHAF1BQ13112 559 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 NAB1Q13506 487 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 DPYSL3Q14195 570 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 LRRC26Q2I0M4 334 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 TYSND1Q2T9J0 566 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 DNAL1Q4LDG9 190 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 CMPK2Q5EBM0 449 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 SLC25A53Q5H9E4 307 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 CCNJQ5T5M9 372 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 C1orf146Q5VVC0 180 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 LIPNQ5VXI9 398 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 SLC8B1Q6J4K2 584 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 PRMT9Q6P2P2 845 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 TTC27Q6P3X3 843 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 FUT10Q6P4F1 479 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 CYP20A1Q6UW02 462 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 MFSD7Q6UXD7 560 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 FAM122BQ7Z309 247 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 TAF8Q7Z7C8 310 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 KLHL7Q8IXQ5 586 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 PRSS58Q8IYP2 241 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 ZNF781Q8N8C0 355 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 STKLD1Q8NE28 680 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 OR8J1Q8NGP2 316 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 RHOXF1Q8NHV9 184 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 SPPL2BQ8TCT7 592 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 MCOLN3Q8TDD5 553 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 FAM172AQ8WUF8 416 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 KCTD4Q8WVF5 259 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 CAPSLQ8WWF8 208 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 MR1Q95460 341 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 TOP1MTQ969P6 601 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 ELMO2Q96JJ3 720 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 SERAC1Q96JX3 654 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 RNF157Q96PX1 679 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 PEBP4Q96S96 227 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 MED10Q9BTT4 135 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 ULBP1Q9BZM6 244 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 FBXO44Q9H4M3 255 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 CWH43Q9H720 699 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 IL26Q9NPH9 171 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 ETNK2Q9NVF9 386 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 P4HTMQ9NXG6 502 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 TXNDC16Q9P2K2 825 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 ZNF175Q9Y473 711 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 SLC22A7Q9Y694 548 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 USH1CQ9Y6N9 552 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 PCNTO95613 3336 aa3.05□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 CLUHO75153 1309 aa3.05□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 SMIM30A4D0T7 59 aa3.05□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 C5orf51A6NDU8 294 aa3.05□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 OR6C70A6NIJ9 312 aa3.05□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 YJEFN3A6XGL0 299 aa3.05□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 HACD1B0YJ81 288 aa3.05□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 I3L4J1 428 aa3.05□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 PFDN6O15212 129 aa3.05□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 ALOX15BO15296 676 aa3.05□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 B4GAT1O43505 415 aa3.05□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 CST8O60676 142 aa3.05□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 MITFO75030 526 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 RHBDL1O75783 438 aa3.05□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 GRAP2O75791 330 aa3.05□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 AKR7A3O95154 331 aa3.05□□□□□ -1.92
HECTD4-210ENST00000549306 ANP32DO95626 131 aa3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms