RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545097.1

CCR3-208, Transcript of C-C motif chemokine receptor 3, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR3, Length 1,786 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCR3-208	ENST00000545097	MYBPH	Q13203	477 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	SELENBP1	Q13228	472 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	SGCB	Q16585	318 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	RABL3	Q5HYI8	236 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	P3H2	Q8IVL5	708 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	CCDC103	Q8IW40	242 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	OR5B2	Q96R09	309 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	PSD2	Q9BQI7	771 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	PIF1	Q9H611	641 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	RMND5A	Q9H871	391 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	PRSS50	Q9UI38	385 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	LIPT1	Q9Y234	373 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	DSCAM	O60469	2012 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	LINC01387	J3KSC0	135 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	CTAG2	O75638	210 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	GPX2	P18283	190 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	ADH6	P28332	368 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	KIR2DL3	P43628	341 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	DIO1	P49895	249 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	ARFIP2	P53365	341 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	CARD18	P57730	90 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	HPCA	P84074	193 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	NPTX1	Q15818	432 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	SYT14P1	Q58G82	188 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	REP15	Q6BDI9	236 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	SNX32	Q86XE0	403 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	DPP10	Q8N608	796 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	ZNF563	Q8TA94	476 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	ST8SIA1	Q92185	356 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	CGREF1	Q99674	301 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	ZNF559	Q9BR84	538 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	ADAM19	Q9H013	955 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	GMEB1	Q9Y692	573 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		7.21	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097		A6NNC1	897 aa		7.21	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	ZNF716	A6NP11	495 aa		7.21	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		7.21	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		7.21	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097		H0YHG0	523 aa		7.21	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	MSTN	O14793	375 aa		7.21	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	THY1	P04216	161 aa		7.21	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	IL7R	P16871	459 aa		7.21	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	PGC	P20142	388 aa		7.21	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	SSTR2	P30874	369 aa		7.21	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	CPA2	P48052	419 aa		7.21	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	P2RY4	P51582	365 aa		7.21	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	CRISP3	P54108	245 aa		7.21	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	CDK6	Q00534	326 aa		7.21	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	EGR4	Q05215	589 aa		7.21	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	LGALS3BP	Q08380	585 aa		7.21	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		7.21	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	RNF220	Q5VTB9	566 aa		7.21	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		7.21	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		7.21	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		7.21	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		7.21	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	FCRLA	Q7L513	359 aa		7.21	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		7.21	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	GRINA	Q7Z429	371 aa		7.21	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		7.21	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	CADM2	Q8N3J6	435 aa		7.21	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	SMYD1	Q8NB12	490 aa		7.21	□□□□□ -1.25
CCR3-208	ENST00000545097	C3orf49	Q96BT1	292 aa		7.21	□□□□□ -1.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.9 ms