RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523636.5

PABPC1-223, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 5

Gene PABPC1, Length 818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-223	ENST00000523636	UNC119B	A6NIH7	251 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	SMIM23	A6NLE4	172 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636		H0YIG0	161 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	PPP6C	O00743	305 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	GPR171	O14626	319 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	PRRG2	O14669	202 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC25A12	O75746	678 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	DFFB	O76075	338 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	NKX2-2	O95096	273 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ACSL3	O95573	720 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	MB	P02144	154 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	SHBG	P04278	402 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CCL2	P13500	99 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	IL7R	P16871	459 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	M6PR	P20645	277 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	MAK	P20794	623 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	TACR2	P21452	398 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CHRNB4	P30926	498 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	FDFT1	P37268	417 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	GRIA1	P42261	906 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CRAT	P43155	626 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	MAGEB1	P43366	347 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC1A6	P48664	564 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	RGS4	P49798	205 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	SERPINB8	P50452	374 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	TNFSF10	P50591	281 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC7A2	P52569	658 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	PPP1CA	P62136	330 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	DGCR2	P98153	550 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	SPOCK1	Q08629	439 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	NFATC2	Q13469	925 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	TNK1	Q13470	666 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	TFDP2	Q14188	446 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	FGFBP1	Q14512	234 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	PTPRCAP	Q14761	206 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	SGCA	Q16586	387 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	PCID2	Q5JVF3	399 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	LGSN	Q5TDP6	509 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	AADACL2	Q6P093	401 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	MON1B	Q7L1V2	547 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	DTX2	Q86UW9	622 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	TDRP	Q86YL5	185 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	LGI2	Q8N0V4	545 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	TTL	Q8NG68	377 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	FCGR1B	Q92637	280 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC25A28	Q96A46	364 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ULK4	Q96C45	1275 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	LINGO1	Q96FE5	620 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	MAGEB18	Q96M61	343 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	GPR137	Q96N19	417 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	NPAS2	Q99743	824 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	RDH8	Q9NYR8	311 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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