RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517072.1

RNU6-334P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 334, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-334P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-334P-201ENST00000517072 PALMDQ9NP74 551 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-334P-201ENST00000517072 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
RNU6-334P-201ENST00000517072 TRDCB7Z8K6 153 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 F5H6K3 240 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 RHOBTB1O94844 696 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 SUPT7LO94864 414 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 UGT2B4P06133 528 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 COX5AP20674 150 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 IMPDH1P20839 514 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 RBMXP38159 391 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 P2RY1P47900 373 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 APOC4P55056 127 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 NUP107P57740 925 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 KLRC3Q07444 240 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 TP53I3Q53FA7 332 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 KCNIP4Q6PIL6 250 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 CES3Q6UWW8 571 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 ANKFN1Q8N957 763 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 OR4D5Q8NGN0 318 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 OR1F12Q8NHA8 337 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 ST8SIA1Q92185 356 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 RAPGEF5Q92565 580 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 PELI1Q96FA3 418 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 TGM7Q96PF1 710 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 HIST1H4GQ99525 98 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 EDEM2Q9BV94 578 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 PLGRKTQ9HBL7 147 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 PIPOXQ9P0Z9 390 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 SNX6Q9UNH7 406 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 SH3TC1Q8TE82 1336 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 PSMB11A5LHX3 300 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 VSTM2BA6NLU5 285 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 K7EQM0 130 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 PNMTP11086 282 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 HTR1EP28566 365 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 CD1BP29016 333 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 NSDHLQ15738 373 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 TPGS2Q68CL5 300 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 CCDC80Q76M96 950 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 RNF138Q8WVD3 245 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 UCN3Q969E3 161 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 SEC22AQ96IW7 307 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZNF607Q96SK3 696 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 SLC25A22Q9H936 323 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 TREM2Q9NZC2 230 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 IL36GQ9NZH8 169 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 COPS3Q9UNS2 423 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 ASF1AQ9Y294 204 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 A0A0G2JRQ6 117 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 LRP5LA4QPB2 252 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 USP27XA6NNY8 438 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 PANO1I0J062 215 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 MAGEB3O15480 346 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 IQCF3P0C7M6 154 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 HSMCR30P0CW71 290 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 COX7A1P24310 79 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 MMP11P24347 488 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 HTR1FP30939 366 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 RFC4P35249 363 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 PTGDSP41222 190 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 BIDP55957 195 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 C10orf120Q5SQS8 335 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 CASC10Q5T4H9 136 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 RNF165Q6ZSG1 346 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 SLC38A6Q8IZM9 456 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 NKAPP1Q8N9T2 125 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 DCAF4L2Q8NA75 395 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZNF740Q8NDX6 193 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 OR51S1Q8NGJ8 323 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZNF799Q96GE5 643 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 MMP26Q9NRE1 261 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 UFSP2Q9NUQ7 469 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 THSD7BQ9C0I4 1608 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 A0A1B0GUS0 222 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 A8MUA0 341 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 SCGNO76038 276 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 ALOX5P09917 674 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 MDKP21741 143 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 LAP3P28838 519 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 CALCRP30988 508 aa3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.4 ms