RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516411.1

RNU6-977P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 977, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-977P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-977P-201ENST00000516411 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 AIPL1Q9NZN9 384 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 OPN4Q9UHM6 478 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 ATP6V1HQ9UI12 483 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 NPIPA1Q9UND3 350 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 B9D1Q9UPM9 204 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 RASD1Q9Y272 281 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 OARD1Q9Y530 152 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 WIF1Q9Y5W5 379 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 SHANK1Q9Y566 2161 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 ABCC4O15439 1325 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 A0A1B0GUL7 405 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 GSAPA4D1B5 854 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 FAM74A7A6NL05 159 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 E9PBE3 544 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 H3BMQ9 156 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 LAD1O00515 517 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 RASGRF2O14827 1237 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 CHADO15335 359 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 DFNA5O60443 496 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 TPST2O60704 377 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 SEC22BO75396 215 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 GNA14O95837 355 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 SLC25A27O95847 323 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 MT-ATP6P00846 226 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 IGLV3-19P01714 112 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 ICAM2P13598 275 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 ETS1P14921 441 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 FUT1P19526 365 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 CELP19835 753 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 COX5AP20674 150 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 NT5EP21589 574 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 OMGP23515 440 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 CMA1P23946 247 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 CCNCP24863 283 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 HOXA9P31269 272 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 YWHABP31946 246 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 EPHX2P34913 555 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 RFC4P35249 363 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 LONP1P36776 959 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 PTGFRP43088 359 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 BDKRB1P46663 353 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 AP3M2P53677 418 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 NAPAP54920 295 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 SLC26A5P58743 744 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 TAS2R19P59542 299 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 PRPS1P60891 318 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 TNFRSF17Q02223 184 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 CNTN2Q02246 1040 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 HSF2Q03933 536 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 SPP2Q13103 211 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 PDZK1IP1Q13113 114 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 MADCAM1Q13477 382 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 GGTLC2Q14390 218 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 CHI3L2Q15782 390 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 IGFBP7Q16270 282 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 LY6EQ16553 131 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 NRF1Q16656 503 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 FAM83EQ2M2I3 478 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 CCDC57Q2TAC2 916 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 FAM74A3Q4VXF1 159 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 ATF7IP2Q5U623 682 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 Q5W150 140 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 FRMPD2BQ6IN97 320 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 CBLN3Q6UW01 205 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 C6orf89Q6UWU4 347 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 CATSPER4Q7RTX7 472 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 TPRA1Q86W33 373 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 PCP2Q8IVA1 136 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 RDH10Q8IZV5 341 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 LINC01561Q8N1V8 128 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 DHRSXQ8N5I4 330 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 C15orf56Q8N910 161 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 Q8N976 141 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZNF740Q8NDX6 193 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 CNNM3Q8NE01 707 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 OR6C4Q8NGE1 309 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 OR56B4Q8NH76 319 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 HTR3CQ8WXA8 447 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 STARD8Q92502 1023 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 PIGCQ92535 297 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 TIMD4Q96H15 378 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 HPDLQ96IR7 371 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 AKR1E2Q96JD6 320 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-977P-201ENST00000516411 FCRL1Q96LA6 429 aa0.43□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms