RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516232.1

RNA5SP228-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 228, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP228, Length 133 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP228-201ENST00000516232 MESDQ14696 234 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 TGFBIQ15582 683 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 RPE65Q16518 533 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 ADPRMQ3LIE5 342 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 CCDC153Q494R4 210 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 SPATS1Q496A3 300 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 CMPK2Q5EBM0 449 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 CTSL3PQ5NE16 218 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 ZNF470Q6ECI4 717 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 FBXO42Q6P3S6 717 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 TEX38Q6PEX7 206 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 WASH2PQ6VEQ5 465 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 C20orf204Q6ZNR8 217 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 TTLL10Q6ZVT0 673 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 UTS2BQ765I0 119 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 PAGE2Q7Z2X7 111 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 SNX20Q7Z614 316 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 C10orf67Q8IYJ2 551 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 MLKLQ8NB16 471 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 OR5D13Q8NGL4 314 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 SMPDL3BQ92485 455 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 OSTF1Q92882 214 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 UBE2FQ969M7 185 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 ADIPOR1Q96A54 375 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 MUS81Q96NY9 551 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 DUX5Q96PT3 197 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 SMIM14Q96QK8 99 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 RAB40CQ96S21 281 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 CPXM1Q96SM3 734 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 ATG101Q9BSB4 218 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 TIMM29Q9BSF4 260 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 LRRC1Q9BTT6 524 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 FNDC11Q9BVV2 318 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 RAB1BQ9H0U4 201 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 PDFQ9HBH1 243 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 FAM60AQ9NP50 221 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 CLEC5AQ9NY25 188 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 ADAM22Q9P0K1 906 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 B4GALT7Q9UBV7 327 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 C3orf18Q9UK00 162 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 SLC45A2Q9UMX9 530 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 NEU3Q9UQ49 428 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 PLLPQ9Y342 182 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 OR10H1Q9Y4A9 318 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 LRRC42Q9Y546 428 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 FREM1Q5H8C1 2179 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 A0A1B0GX78 115 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 RAB19A4D1S5 217 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 E7ESA3 106 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 FAM72CH0Y354 149 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 IFNL4K9M1U5 179 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 WWP2O00308 870 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 KMOO15229 486 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 ITGA10O75578 1167 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 UPK3AO75631 287 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 TJP3O95049 919 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 ZFPL1O95159 310 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 RAB3DO95716 219 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 CBX7O95931 251 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 MT-ND2P03891 347 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 HIST1H2ABP04908 130 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 FCER2P06734 321 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 SERPINA6P08185 405 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 ANXA5P08758 320 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 RAB4AP20338 218 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 HIST1H2ADP20671 130 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 FUT4P22083 530 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 S100A1P23297 94 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 CXCR2P25025 360 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 DPP4P27487 766 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 ACADLP28330 430 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP228-201ENST00000516232 IL12BP29460 328 aa4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.7 ms