RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514813.6

RRN3P1-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3P1, Length 3,645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-201ENST00000514813 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC18A1P54219 525 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 LGALS4P56470 323 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 FOXF1Q12946 379 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 OGFOD2Q6N063 350 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 H3F3CQ6NXT2 135 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 RGS9BPQ6ZS82 235 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 CTHRC1Q96CG8 243 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 CGREF1Q99674 301 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 MED18Q9BUE0 208 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 TIGARQ9NQ88 270 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 DUSP22Q9NRW4 184 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 A0A1W2PPL8 197 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 ATP8B1O43520 1251 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 TPST1O60507 370 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 AMY2AP04746 511 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 NAGAP17050 411 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 AMY2BP19961 511 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 TNFRSF1BP20333 461 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 CENPAP49450 140 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC7A2P52569 658 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 C1DQ13901 141 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 DAG1Q14118 895 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 ARMC8Q8IUR7 673 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 CCDC197Q8NCU1 140 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 NRG4Q8WWG1 115 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 TESCQ96BS2 214 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 FANCD2OSQ96PS1 177 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 HOXD1Q9GZZ0 328 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM27Q9HBJ8 222 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 GPATCH2Q9NW75 528 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 RABL2BQ9UNT1 228 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 A0A1W2PP18 115 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 TMPRSS2O15393 492 aa5.91□□□□□ -1.46
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RRN3P1-201ENST00000514813 NKX2-2O95096 273 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 PGM3O95394 542 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 OR1E2P47887 323 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP5.91□□□□□ -1.46
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RRN3P1-201ENST00000514813 CMTM5Q96DZ9 223 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 CCT8L2Q96SF2 557 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 ANGPTL4Q9BY76 406 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 RTN4RQ9BZR6 473 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 MED17Q9NVC6 651 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 CALML5Q9NZT1 146 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 LIPT1Q9Y234 373 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 SONP18583 2426 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
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RRN3P1-201ENST00000514813 C11orf98E9PRG8 122 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 BCKDKO14874 412 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 NCK1P16333 377 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF117Q03924 483 aa5.91□□□□□ -1.46
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RRN3P1-201ENST00000514813 RGNQ15493 299 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 OR7A5Q15622 319 aa5.91□□□□□ -1.46
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RRN3P1-201ENST00000514813 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF787Q6DD87 383 aa5.91□□□□□ -1.46
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RRN3P1-201ENST00000514813 IGFL2Q6UWQ7 119 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 CYP2R1Q6VVX0 501 aa5.91□□□□□ -1.46
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RRN3P1-201ENST00000514813 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 STK32CQ86UX6 486 aa5.91□□□□□ -1.46
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RRN3P1-201ENST00000514813 GTF2H4Q92759 462 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 OTULINQ96BN8 352 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 SH3GL1Q99961 368 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 SLX1AQ9BQ83 275 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 SAR1AQ9NR31 198 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 SPRR3Q9UBC9 169 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 POU2F3Q9UKI9 436 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 ADAM21Q9UKJ8 722 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 C15orf41Q9Y2V0 281 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 CLCA1A8K7I4 914 aa5.9□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 HMGN4O00479 90 aa5.9□□□□□ -1.46
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