RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 CCT8L1PA6NM43 557 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 A8MVM7 634 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 B2RBV5 119 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 SHISA8B8ZZ34 492 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 TNFSF11O14788 317 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 OR2T1O43869 369 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 STAMBPO95630 424 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 PMS2P2O95744 297 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 FESP07332 822 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 GKN3PP0CG01 181 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 HSD17B1P14061 328 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 CD247P20963 164 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 SELENOWP63302 87 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 DMTNQ08495 405 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 MFSD13AQ14CX5 517 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 PON3Q15166 354 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 ELOA3BQ3SY89 546 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF613Q6PF04 617 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 ADGRG3Q86Y34 549 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 SMYD1Q8NB12 490 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 ELOA3Q8NG57 546 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 ADGRG7Q96K78 797 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 OR5B2Q96R09 309 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 EPYCQ99645 322 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 TAPBPLQ9BX59 468 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 EMC9Q9Y3B6 208 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A0G2JNJ9 132 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A0J9YW62 118 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 SULT2B1O00204 365 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 CXCR6O00574 342 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 NME4O00746 187 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 CXCL13O43927 109 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 ATP5HO75947 161 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 PRKD3O94806 890 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 ENPP1P22413 925 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 CPA2P48052 419 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 GSK3BP49841 420 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 CTBP2P56545 445 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC35A1P78382 337 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 NRF1Q16656 503 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 DUSP7Q16829 419 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 PPP4R4Q6NUP7 873 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 POMZP3Q6PJE2 187 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 C6orf89Q6UWU4 347 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 MARVELD2Q8N4S9 558 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 FIG4Q92562 907 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM162AQ96A26 154 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 MPP4Q96JB8 637 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 MCHR1Q99705 422 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 ARHGDIGQ99819 225 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 MUC13Q9H3R2 512 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM185BQ9H7F4 350 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 RNF122Q9H9V4 155 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 KLHL9Q9P2J3 617 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 Q9UFV3 132 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 NCKAP5O14513 1909 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 HTR3EA5X5Y0 456 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 TPST1O60507 370 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 GPIP06744 558 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 FREM3P0C091 2139 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 THRBP10828 461 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 IDUAP35475 653 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 DIO1P49895 249 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 PLAURQ03405 335 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 BNIP2Q12982 314 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 OR1Q1Q15612 314 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 CYBRD1Q53TN4 286 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 ALG10BQ5I7T1 473 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 DEFB107AQ8IZN7 70 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 C9orf106Q8NAJ2 232 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 OR6S1Q8NH40 331 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 PIGXQ8TBF5 258 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 C3orf49Q96BT1 292 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 TAMM41Q96BW9 452 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 CDRT15Q96T59 188 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 PCDHAC1Q9H158 963 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 GORASP2Q9H8Y8 452 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 SH3GLB1Q9Y371 365 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 CHST2Q9Y4C5 530 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 MYO7BQ6PIF6 2116 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 GPR171O14626 319 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 EFNA2O43921 213 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 AHSA1O95433 338 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-208ENST00000504294 OPN1SWP03999 348 aa13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms