RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504270.2

CD27-AS1-204, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD27-AS1, Length 700 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-204ENST00000504270 EPS8Q12929 822 aa9.88□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 BCL2A1Q16548 175 aa9.88□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 EMC4Q5J8M3 183 aa9.88□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 PDSS1Q5T2R2 415 aa9.88□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 C1orf185Q5T7R7 199 aa9.88□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa9.88□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa9.88□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 PGAM4Q8N0Y7 254 aa9.88□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 POC1BQ8TC44 478 aa9.88□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 PROX1Q92786 737 aa9.88□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 NINJ1Q92982 152 aa9.88□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 NPAS1Q99742 590 aa9.88□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 SMR3AQ99954 134 aa9.88□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 UCK2Q9BZX2 261 aa9.88□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 PRDM14Q9GZV8 571 aa9.88□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 LIME1Q9H400 295 aa9.88□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 SELENONQ9NZV5 590 aa9.88□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 TMEM181Q9P2C4 612 aa9.88□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 KCNN3Q9UGI6 736 aa9.88□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 PACSIN3Q9UKS6 424 aa9.88□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 ZNF682O95780 498 aa9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 ZNF708P17019 499 aa9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 IL11P20809 199 aa9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 CXCR1P25024 350 aa9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 ELK4P28324 431 aa9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 SLC7A1P30825 629 aa9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 KDELR2P33947 212 aa9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 SLC1A3P43003 542 aa9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 HTR3AP46098 478 aa9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 CLDN18P56856 261 aa9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 CLDN20P56880 219 aa9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 CBX1P83916 185 aa9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 TFF3Q07654 80 aa9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 TMEM44Q2T9K0 475 aa9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 WBP2NLQ6ICG8 309 aa9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 CCDC80Q76M96 950 aa9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 GRINAQ7Z429 371 aa9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 P4HA3Q7Z4N8 544 aa9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 OR52E4Q8NGH9 312 aa9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 LZICQ8WZA0 190 aa9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 FAM162AQ96A26 154 aa9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 TAMM41Q96BW9 452 aa9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 TPD52L3Q96J77 140 aa9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 TUBA1CQ9BQE3 449 aa9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 PRRG4Q9BZD6 226 aa9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 TMEM27Q9HBJ8 222 aa9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 CTPS2Q9NRF8 586 aa9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 ADPRHL2Q9NX46 363 aa9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 EGFL7Q9UHF1 273 aa9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 BAG5Q9UL15 447 aa9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 JMJD1CQ15652 2540 aa9.87□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa9.86□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 CLCA1A8K7I4 914 aa9.86□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 H0YC42 278 aa9.86□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 FAAHO00519 579 aa9.86□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 TNFSF11O14788 317 aa9.86□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 ADAM11O75078 769 aa9.86□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 TOXO94900 526 aa9.86□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 UBOX5O94941 541 aa9.86□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 SYNGR4O95473 234 aa9.86□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 FESP07332 822 aa9.86□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 C8BP07358 591 aa9.86□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 T-ENOLP0DO92 83 aa9.86□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 NCK1P16333 377 aa9.86□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 TACR3P29371 465 aa9.86□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 KCNJ5P48544 419 aa9.86□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 CLDN15P56746 228 aa9.86□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 CARD18P57730 90 aa9.86□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 PLAURQ03405 335 aa9.86□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 SELENBP1Q13228 472 aa9.86□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 DUSP7Q16829 419 aa9.86□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 CYBRD1Q53TN4 286 aa9.86□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 SLC25A53Q5H9E4 307 aa9.86□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 HBMQ6B0K9 141 aa9.86□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 C3orf33Q6P1S2 294 aa9.86□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 RINLQ6ZS11 566 aa9.86□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 FKBP9P1Q75LS8 142 aa9.86□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 BIVMQ86UB2 503 aa9.86□□□□□ -0.83
CD27-AS1-204ENST00000504270 RPRMLQ8N4K4 120 aa9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms