RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502394.1

MATR3-231, Transcript of matrin 3, human

TSL 4

Gene MATR3, Length 589 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MATR3-231	ENST00000502394	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	EGR4	Q05215	589 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	PRKCD	Q05655	676 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	FOXF1	Q12946	379 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	KCNAB2	Q13303	367 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	RFX4	Q33E94	735 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	NRM	Q8IXM6	262 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	OR2M7	Q8NG81	312 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	PFN4	Q8NHR9	129 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	PIGX	Q8TBF5	258 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	TMEM234	Q8WY98	164 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	MBOAT4	Q96T53	435 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	HES7	Q9BYE0	225 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	RAX	Q9Y2V3	346 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		11	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		11	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		11	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	EFNA2	O43921	213 aa		11	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	GMFG	O60234	142 aa		11	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	ZIC3	O60481	467 aa		11	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	FZD7	O75084	574 aa		11	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	CBR3	O75828	277 aa		11	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	NUDT14	O95848	222 aa		11	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	SP1	P08047	785 aa		11	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	C1QTNF9	P0C862	333 aa		11	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	FPR3	P25089	353 aa		11	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	ADH6	P28332	368 aa		11	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	RAD23A	P54725	363 aa		11	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	UCN	P55089	124 aa		11	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	COX10	Q12887	443 aa		11	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	TSPAN31	Q12999	210 aa		11	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	BROX	Q5VW32	411 aa		11	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		11	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		11	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		11	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	SULF2	Q8IWU5	870 aa		11	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		11	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	LIPH	Q8WWY8	451 aa		11	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	TFAP2C	Q92754	450 aa		11	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	GNRHR2	Q96P88	292 aa		11	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	TOR3A	Q9H497	397 aa		11	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		11	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		11	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	KRT84	Q9NSB2	600 aa		11	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		11	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	SELENON	Q9NZV5	590 aa		11	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		11	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	MED31	Q9Y3C7	131 aa		11	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		11	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	IGF2R	P11717	2491 aa		10.99	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	FRY	Q5TBA9	3013 aa		10.99	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	TMEM72	A0PK05	275 aa		10.99	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		10.99	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	CDC42EP2	O14613	210 aa		10.99	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	SLC16A6	O15403	523 aa		10.99	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		10.99	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	MAK	P20794	623 aa		10.99	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	PTN	P21246	168 aa		10.99	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	DPP4	P27487	766 aa		10.99	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	SRD5A2	P31213	254 aa		10.99	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	IFNGR2	P38484	337 aa		10.99	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	MASP1	P48740	699 aa		10.99	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	GPR85	P60893	370 aa		10.99	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	ARG2	P78540	354 aa		10.99	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	MERTK	Q12866	999 aa		10.99	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	FHL1	Q13642	323 aa		10.99	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		10.99	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		10.99	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	SLC36A3	Q495N2	470 aa		10.99	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		10.99	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		10.99	□□□□□ -0.65
MATR3-231	ENST00000502394	USP51	Q70EK9	711 aa		10.99	□□□□□ -0.65

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