RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 C1RLQ9NZP8 487 aa6.61□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 VAPAQ9P0L0 249 aa6.61□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 LHX3Q9UBR4 397 aa6.61□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF225Q9UK10 706 aa6.61□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 HEG1Q9ULI3 1381 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 TRAV24A0A0B4J272 114 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 LRRC3CA6NJW4 275 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 DCTN6O00399 190 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 CDIPTO14735 213 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 TFECO14948 347 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 PRKYO43930 277 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 LDB3O75112 727 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 RCBTB2O95199 551 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 ZBTB7AO95365 584 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 IGHV2-70P01814 119 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 ORM1P02763 201 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 PRKCGP05129 697 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 HCKP08631 526 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 PRF1P14222 555 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 HLA-GP17693 338 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 CELP19835 753 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 TBXA2RP21731 343 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 BCKDHBP21953 392 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 AADACP22760 399 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 IVDP26440 423 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 GPR1P46091 355 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 MEOX2P50222 304 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 CDC42P60953 191 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 RBX1P62877 108 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 DHODHQ02127 395 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 FPGSQ05932 587 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 KLRC3Q07444 240 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 FOXE3Q13461 319 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 CCDC6Q16204 474 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 MAPK14Q16539 360 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 VASNQ6EMK4 673 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 TAPT1Q6NXT6 567 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 SPRED2Q7Z698 418 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 UNC93AQ86WB7 457 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 IZUMO1Q8IYV9 350 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 LGI3Q8N145 548 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 CFAP52Q8N1V2 620 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 OR10W1Q8NGF6 305 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 OR2T11Q8NH01 316 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 OR52I2Q8NH67 350 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 RSPRY1Q96DX4 576 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 NUS1Q96E22 293 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 PELI1Q96FA3 418 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 OR14A2Q96R54 314 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 PHB2Q99623 299 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 CD320Q9NPF0 282 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 RGS18Q9NS28 235 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 MAT2BQ9NZL9 334 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 OR14J1Q9UGF5 321 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 USH1CQ9Y6N9 552 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 GRID2IPA4D2P6 1211 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 A6NNC1 897 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 DISC1C4P0D8 188 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 E5RJQ4 531 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 F8VVB4 439 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 F8VWA3 439 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 hCG_2039718K7EN88 272 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 SIRPB1O00241 398 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 CCRL2O00421 344 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 ZBTB5O15062 677 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 PFDN6O15212 129 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 SLC16A5O15375 505 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 GSRP00390 522 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 IFNW1P05000 195 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 ADH4P08319 380 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 CT45A8P0DMV1 189 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 CT45A9P0DMV2 189 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 DPEP1P16444 411 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 RAB3AP20336 220 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 PROZP22891 400 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 SSTR2P30874 369 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 CA5AP35218 305 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 KIR2DL3P43628 341 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 RGRP47804 291 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 HCAR3P49019 387 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 ADPRHP54922 357 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 OR2B8PP59922 312 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 MESP2Q0VG99 397 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 BAMBIQ13145 260 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 DNASE1L3Q13609 305 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 TFDP1Q14186 410 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PDCD4-211ENST00000498367 UBXN2BQ14CS0 331 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms