RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 B4DXG7 233 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 PLA2G10O15496 165 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 FMO6PO60774 539 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 AK1P00568 194 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 PSKH1P11801 424 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 FHL1Q13642 323 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 GXYLT1Q4G148 440 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 FAM27D1Q5T7N8 215 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 OAFQ86UD1 273 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 LRRC17Q8N6Y2 441 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 GDPD1Q8N9F7 314 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 OR4C3Q8NH37 302 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 DEDD2Q8WXF8 326 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 VSTM2LQ96N03 204 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 RNF32Q9H0A6 362 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 CMC2Q9NRP2 79 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 GPR27Q9NS67 375 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-213ENST00000492657 DAPL1A0PJW8 107 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 CIB4A0PJX0 185 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 HLA-DPB1P04440 258 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 RNH1P13489 461 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 GFERP55789 205 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 GAS6Q14393 721 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 ZNF613Q6PF04 617 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 KIRREL2Q6UWL6 708 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 GLRX5Q86SX6 157 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 NR2C2APQ86WQ0 139 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 GID4Q8IVV7 300 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 CCDC28AQ8IWP9 274 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 GALNT6Q8NCL4 622 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 OR51L1Q8NGJ5 315 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 FRMD6Q96NE9 622 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 ATF6BQ99941 703 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 CDCP1Q9H5V8 836 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 MCCC2Q9HCC0 563 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 BABAM2Q9NXR7 383 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 ERVK-19Q9WJR5 959 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 MTCH2Q9Y6C9 303 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 FAM86C2PA6NEL3 165 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 UBL4AP11441 157 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 IGFBP4P22692 258 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 E2F1Q01094 437 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 P2RY14Q15391 338 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP11.83□□□□□ -0.522e-8■■□□□ 11.9
PRAME-213ENST00000492657 ALG10BQ5I7T1 473 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 ARL9Q6T311 187 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 RPTNQ6XPR3 784 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 LMX1AQ8TE12 382 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 AP3S1Q92572 193 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 RNF121Q9H920 327 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 SLC23A1Q9UHI7 598 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 CDK2AP1O14519 115 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 IMPA2O14732 288 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 RNF13O43567 381 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 CHP2O43745 196 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 CTNSO60931 367 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 IGLV3-19P01714 112 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 RPS5P46782 204 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 CTBP2P56545 445 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 FAPQ12884 760 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 TATDN3Q17R31 274 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 CNIH2Q6PI25 160 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 RFLNBQ8N5W9 214 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 FAM181AQ8N9Y4 354 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 GATSQ8NAP1 163 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 C19orf18Q8NEA5 215 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 UCKL1Q9NWZ5 548 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 CACNA1CQ13936 2221 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 TMEM131Q92545 1883 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 CT45A8P0DMV1 189 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 CT45A9P0DMV2 189 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 ENPP1P22413 925 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 ACSM1Q08AH1 577 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 IL18Q14116 193 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 QPRTQ15274 297 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 CT45A2Q5DJT8 189 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 LCN1P1Q5VSP4 162 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 NKAIN2Q5VXU1 208 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 TRIQKQ629K1 86 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 PLET1Q6UQ28 207 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 SSX6Q7RTT6 188 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 RDH10Q8IZV5 341 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 Q8N402 240 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 FAM109AQ8N4B1 249 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 OR5M3Q8NGP4 307 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-213ENST00000492657 OR4C6Q8NH72 309 aa11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms