RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF621Q6ZSS3 439 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 TRIML2Q8N7C3 387 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 Q96MF0 132 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 MANSC1Q9H8J5 431 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 RAMP1O60894 148 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 PMS2P2O95744 297 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 IL32P24001 234 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 IDH2P48735 452 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 LRRC74AQ0VAA2 488 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 PDK3Q15120 406 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 CMIPQ8IY22 773 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF563Q8TA94 476 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 HSD17B8Q92506 261 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 OR52B2Q96RD2 323 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 DSPPQ9NZW4 1301 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 SLCO1B7G3V0H7 640 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 IDO1P14902 403 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 IGHV1-2P23083 117 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 HPCAP84074 193 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 H3F3AP84243 136 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 ATG16L1Q676U5 607 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 DNAJA3Q96EY1 480 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 POTEKPQ9BYX7 375 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 CSPG4Q6UVK1 2322 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 FAAHO00519 579 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 LYZL6O75951 148 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 IL6P05231 212 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 SLC16A1P53985 500 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 Q71RC1 249 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 GALNT5Q7Z7M9 940 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 ZBTB18Q99592 522 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 OSGIN1Q9UJX0 560 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 RNF115Q9Y4L5 304 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-211ENST00000490677 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 DPRXA6NFQ7 191 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 H7C1Q1 480 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 RFXANKO14593 260 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 KLF11O14901 512 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 DNPH1O43598 174 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 SLC22A3O75751 556 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 ZCCHC18P0CG32 403 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 TFPIP10646 304 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 CLK1P49759 484 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 LTBQ06643 244 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 GTDC1Q4AE62 458 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 ALKBH2Q6NS38 261 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 OR9I1Q8NGQ6 314 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 WDR60Q8WVS4 1066 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 PMM1Q92871 262 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 NEUROG1Q92886 237 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 ZIM2Q9NZV7 527 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 CR1P17927 2039 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 TRIM64A6NGJ6 449 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 TRIM64BA6NI03 449 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 PGM3O95394 542 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 DANCRP0C864 163 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 IMPDH2P12268 514 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 MAGEA8P43361 318 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 EPS8Q12929 822 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 NXNQ6DKJ4 435 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 CCDC103Q8IW40 242 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM171Q8WVE6 324 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 ADAM19Q9H013 955 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 TRAPPC4Q9Y296 219 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 TMED7Q9Y3B3 224 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM72A0PK05 275 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 OVOL3O00110 214 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 TMCC2O75069 709 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 KRT75O95678 551 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 DBIP07108 87 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 NR2F1P10589 423 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 ETFAP13804 333 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 HTR3AP46098 478 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 BSPH1Q075Z2 132 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 GSTA3Q16772 222 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-211ENST00000490677 VPS33AQ96AX1 596 aa24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms