RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490653.1

PRPF4B-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF4B, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-208ENST00000490653 TLCD1Q96CP7 247 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 MBD6Q96DN6 1003 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 DTNBP1Q96EV8 351 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 OR52B2Q96RD2 323 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC39A3Q9BRY0 314 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC35A5Q9BS91 424 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 MED18Q9BUE0 208 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF350Q9GZX5 532 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 UBTD1Q9HAC8 227 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 CTPS2Q9NRF8 586 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 ELOVL5Q9NYP7 299 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 PRSS50Q9UI38 385 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 ADAM21Q9UKJ8 722 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 ZANQ9Y493 2812 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 DBX1A6NMT0 343 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 AP3D1O14617 1153 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 DNAJA2O60884 412 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 STX11O75558 287 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 PLGP00747 810 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 CSTAP01040 98 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 CHRM4P08173 479 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 KRT16P08779 473 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 UBL4AP11441 157 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 EIF1P41567 113 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 MVDP53602 400 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 OCRLQ01968 901 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 FGFBP1Q14512 234 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 ACKR1Q16570 336 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 GPAT3Q53EU6 434 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 ANXA8L1Q5VT79 327 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 NXNQ6DKJ4 435 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 TFAP2EQ6VUC0 442 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 FCRLAQ7L513 359 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 C16orf62Q7Z3J2 963 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 ADGRG3Q86Y34 549 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF619Q8N2I2 560 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 OR9I1Q8NGQ6 314 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 OR6K3Q8NGY3 331 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 MIPOL1Q8TD10 442 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 RNF128Q8TEB7 428 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 ZFP90Q8TF47 636 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 NEUROG1Q92886 237 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 TESCQ96BS2 214 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 NEURL3Q96EH8 262 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 ARL5BQ96KC2 179 aa6.49□□□□□ -1.37
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PRPF4B-208ENST00000490653 OR11A1Q9GZK7 315 aa6.49□□□□□ -1.37
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PRPF4B-208ENST00000490653 ACER3Q9NUN7 267 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 THAP1Q9NVV9 213 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 BTNL2Q9UIR0 455 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 PCDHGB4Q9UN71 923 aa6.49□□□□□ -1.37
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PRPF4B-208ENST00000490653 WDR45Q9Y484 360 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 COL6A5A8TX70 2615 aa6.48□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 ARID1AO14497 2285 aa6.48□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 USF3Q68DE3 2245 aa6.48□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 TMEM72A0PK05 275 aa6.48□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 DUXAA6NLW8 204 aa6.48□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 E9PBE3 544 aa6.48□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 H3BNH8 94 aa6.48□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 HDAC3O15379 428 aa6.48□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 KIAA0513O60268 411 aa6.48□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 PRKD3O94806 890 aa6.48□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 ADAP00813 363 aa6.48□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 IGHV3-9P01782 118 aa6.48□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 PGRP06401 933 aa6.48□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 IMPDH2P12268 514 aa6.48□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 ETFAP13804 333 aa6.48□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 ME2P23368 584 aa6.48□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 IDH2P48735 452 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 PCYT1AP49585 367 aa6.48□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 RAC3P60763 192 aa6.48□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 KCNJ10P78508 379 aa6.48□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 MERTKQ12866 999 aa6.48□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 CBFBQ13951 182 aa6.48□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 FBLN7Q53RD9 439 aa6.48□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.48□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 PDSS1Q5T2R2 415 aa6.48□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 AP1ARQ63HQ0 302 aa6.48□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 TMPPEQ6ZT21 453 aa6.48□□□□□ -1.37
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