RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484375.5

ARPC1B-218, Transcript of actin related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

TSL 3

Gene ARPC1B, Length 785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1B-218ENST00000484375 SERPINA1P01009 418 aa20.3■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 IL2RAP01589 272 aa20.3■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 IL11P20809 199 aa20.3■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 AGAP20933 346 aa20.3■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 BNIP1Q12981 228 aa20.3■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 OR2A2Q6IF42 318 aa20.3■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 ZNF613Q6PF04 617 aa20.3■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 C5orf46Q6UWT4 87 aa20.3■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 C6orf89Q6UWU4 347 aa20.3■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 P4HA3Q7Z4N8 544 aa20.3■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 ADGRG3Q86Y34 549 aa20.3■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa20.3■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 OR10D3Q8NH80 312 aa20.3■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 SSC4DQ8WTU2 575 aa20.3■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 C3orf49Q96BT1 292 aa20.3■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 SLC47A1Q96FL8 570 aa20.3■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 MCHR1Q99705 422 aa20.3■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 PCDHAC1Q9H158 963 aa20.3■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 CLCF1Q9UBD9 225 aa20.3■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 SLC22A20A6NK97 555 aa20.29■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 HSPB2A8KAH6 182 aa20.29■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 TNFSF11O14788 317 aa20.29■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 EFNA2O43921 213 aa20.29■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 SYNGR4O95473 234 aa20.29■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 STAMBPO95630 424 aa20.29■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 GLI4P10075 376 aa20.29■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 TFPIP10646 304 aa20.29■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 IFNA8P32881 189 aa20.29■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 CARD18P57730 90 aa20.29■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 HOXC5Q00444 222 aa20.29■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 PMPCAQ10713 525 aa20.29■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 CEACAM7Q14002 265 aa20.29■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 HSPB2Q16082 182 aa20.29■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 ELOA3BQ3SY89 546 aa20.29■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 ALG10BQ5I7T1 473 aa20.29■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 CARM1Q86X55 608 aa20.29■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 ELOA3Q8NG57 546 aa20.29■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 OR6T1Q8NGN1 323 aa20.29■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 OR5B2Q96R09 309 aa20.29■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 BTBD10Q9BSF8 475 aa20.29■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 A0A0J9YW62 118 aa20.28■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 A0A1B0GWA3 101 aa20.28■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 DNPH1O43598 174 aa20.28■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 LDLRP01130 860 aa20.28■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 NCK1P16333 377 aa20.28■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 HTR2AP28223 471 aa20.28■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 NUP107P57740 925 aa20.28■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 CBX1P83916 185 aa20.28■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 OR1Q1Q15612 314 aa20.28■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 IFI44LQ53G44 452 aa20.28■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 MTX3Q5HYI7 312 aa20.28■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa20.28■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 XKRXQ6PP77 449 aa20.28■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 FKBP9P1Q75LS8 142 aa20.28■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 FAM156AQ8NDB6 213 aa20.28■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa20.28■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 ASB5Q8WWX0 329 aa20.28■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa20.28■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 NSMCE2Q96MF7 247 aa20.28■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 PRRG4Q9BZD6 226 aa20.28■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 PACSIN3Q9UKS6 424 aa20.28■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 RELNP78509 3460 aa20.28■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 MYO7BQ6PIF6 2116 aa20.27■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa20.27■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 A0A0B4J2E0 115 aa20.27■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 A0A1B0GX12 115 aa20.27■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 A8MVM7 634 aa20.27■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 H0YC42 278 aa20.27■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 ARPC2O15144 300 aa20.27■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 PMS2P2O95744 297 aa20.27■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 IFNW1P05000 195 aa20.27■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 RAC3P60763 192 aa20.27■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 PON3Q15166 354 aa20.27■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 ENTPD8Q5MY95 495 aa20.27■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa20.27■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa20.27■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 RPRMLQ8N4K4 120 aa20.27■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 MARVELD2Q8N4S9 558 aa20.27■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 STK35Q8TDR2 534 aa20.27■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 OSTF1Q92882 214 aa20.27■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 POTEKPQ9BYX7 375 aa20.27■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 COQ10BQ9H8M1 238 aa20.27■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 ACTR3BQ9P1U1 418 aa20.27■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 TRAPPC4Q9Y296 219 aa20.27■□□□□ 0.84
ARPC1B-218ENST00000484375 FLNCQ14315 2725 aa20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms