RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 P04436 131 aa16.04■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GIPRP48546 466 aa16.04■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC9A3R2Q15599 337 aa16.04■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LACC1Q8IV20 430 aa16.04■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TERB2Q8NHR7 220 aa16.04■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HHLA2Q9UM44 414 aa16.04■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CDHR4A6H8M9 788 aa16.04■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FBXO24O75426 580 aa16.04■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FOSL1P15407 271 aa16.04■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RAB4AP20338 218 aa16.04■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRKAR1BP31321 381 aa16.04■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TNK1Q13470 666 aa16.04■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SERTAD2Q14140 314 aa16.04■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IRF4Q15306 451 aa16.04■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NIPAL3Q6P499 406 aa16.04■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa16.04■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CLEC14AQ86T13 490 aa16.04■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC39A11Q8N1S5 342 aa16.04■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR14L1PQ8NHC6 308 aa16.04■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF583Q96ND8 569 aa16.04■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NICN1Q9BSH3 213 aa16.04■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 B3GNT2Q9NY97 397 aa16.04■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 POLHQ9Y253 713 aa16.04■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KLK4Q9Y5K2 254 aa16.04■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CPNE6O95741 557 aa16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RAB31Q13636 194 aa16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC22A6Q4U2R8 563 aa16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DPPA4Q7L190 304 aa16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TBC1D20Q96BZ9 403 aa16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MCOLN1Q9GZU1 580 aa16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MED20Q9H944 212 aa16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SERTAD4Q9NUC0 356 aa16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LUZP4Q9P127 313 aa16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 VDAC3Q9Y277 283 aa16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 USP54Q70EL1 1684 aa16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TGM6O95932 706 aa16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ARAFP10398 606 aa16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GDNFP39905 211 aa16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC14A1Q13336 389 aa16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF534Q76KX8 674 aa16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SORCS2Q96PQ0 1159 aa16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ARNT2Q9HBZ2 717 aa16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HHLA1C9JL84 531 aa16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CSO75390 466 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HBMQ6B0K9 141 aa16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZFAND1Q8TCF1 268 aa16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 STRADBQ9C0K7 418 aa16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC25A31Q9H0C2 315 aa16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GJE1A6NN92 205 aa16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRBOX1C9JBD0 128 aa16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR7A17O14581 309 aa16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ACOT8O14734 319 aa16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC16A7O60669 478 aa16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CTSCP53634 463 aa16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TSPAN31Q12999 210 aa16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GPR18Q14330 331 aa16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LIPIQ6XZB0 460 aa16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RTP3Q9BQQ7 232 aa16.03■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A0A0B4J2A0 478 aa16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SURF4O15260 269 aa16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IRF2P14316 349 aa16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RUNX3Q13761 415 aa16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 B3GLCTQ6Y288 498 aa16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR6V1Q8N148 313 aa16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TM9SF4Q92544 642 aa16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GCM1Q9NP62 436 aa16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SHPKQ9UHJ6 478 aa16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BOLA1Q9Y3E2 137 aa16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CACNA1SQ13698 1873 aa16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM82A0PJX8 343 aa16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C1orf105O95561 183 aa16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SERPINA2P20848 420 aa16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AOAHP28039 575 aa16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ERVK-16P61578 105 aa16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LYSMD2Q8IV50 215 aa16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ASB11Q8WXH4 323 aa16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BORCS7Q96B45 105 aa16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ELOVL3Q9HB03 270 aa16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms