RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SSR4-208	ENST00000471880	CDHR4	A6H8M9	788 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	FRS3	O43559	492 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	ADAM11	O75078	769 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	KLK2	P20151	261 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	AQP1	P29972	269 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	ARFIP2	P53365	341 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	PLAUR	Q03405	335 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	EPS8	Q12929	822 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	NFYC	Q13952	458 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	GUSBP1	Q15486	140 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	CYP51A1	Q16850	503 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	BEND4	Q6ZU67	534 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	KRT73	Q86Y46	540 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	RNF217	Q8TC41	542 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	IFT52	Q9Y366	437 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	HIVEP1	P15822	2718 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM72	A0PK05	275 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	DNAJA2	O60884	412 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	PGM3	O95394	542 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	YES1	P07947	543 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	THBS1	P07996	1170 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	SLC1A3	P43003	542 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	HOXC5	Q00444	222 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	CDK6	Q00534	326 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	SCARB2	Q14108	478 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	MMEL1	Q495T6	779 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	ARL5B	Q96KC2	179 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	LIME1	Q9H400	295 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	EDAR	Q9UNE0	448 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	ARAF	P10398	606 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	PRG2	P13727	222 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	SLC6A2	P23975	617 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	IL32	P24001	234 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	DNASE1	P24855	282 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	CCKAR	P32238	428 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	MTPN	P58546	118 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	NCALD	P61601	193 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	TSC22D1	Q15714	1073 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	RNF220	Q5VTB9	566 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	REEP3	Q6NUK4	255 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	SERPINA11	Q86U17	422 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	PSD2	Q9BQI7	771 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	MED4	Q9NPJ6	270 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	EMC3	Q9P0I2	261 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	AKAP9	Q99996	3911 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	CYTIP	O60759	359 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	IDUA	P35475	653 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	ART1	P52961	327 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	BNIP2	Q12982	314 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SSR4-208	ENST00000471880	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		13.17	□□□□□ -0.3

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