RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468534.1

CCDC88A-210, Transcript of coiled-coil domain containing 88A, humanhuman

TSL 3

Gene CCDC88A, Length 536 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CCDC88A-210ENST00000468534 MTUS2Q5JR59 1369 aa4.28□□□□□ -1.72
CCDC88A-210ENST00000468534 JCADQ9P266 1359 aa4.28□□□□□ -1.72
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CCDC88A-210ENST00000468534 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa4.28□□□□□ -1.72
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CCDC88A-210ENST00000468534 A0A1B0GUV1 79 aa4.28□□□□□ -1.72
CCDC88A-210ENST00000468534 A0A1W2PNV4 684 aa4.28□□□□□ -1.72
CCDC88A-210ENST00000468534 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa4.28□□□□□ -1.72
CCDC88A-210ENST00000468534 ZNF98A6NK75 572 aa4.28□□□□□ -1.72
CCDC88A-210ENST00000468534 CLDN34H7C241 214 aa4.28□□□□□ -1.72
CCDC88A-210ENST00000468534 M0QZ24 198 aa4.28□□□□□ -1.72
CCDC88A-210ENST00000468534 PDHXO00330 501 aa4.28□□□□□ -1.72
CCDC88A-210ENST00000468534 VCYO14598 125 aa4.28□□□□□ -1.72
CCDC88A-210ENST00000468534 PLPP2O43688 288 aa4.28□□□□□ -1.72
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