RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa16.87■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 OR5K4A6NMS3 321 aa16.87■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 LANCL1O43813 399 aa16.87■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 TYRP1P17643 537 aa16.87■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 SLC6A1P30531 599 aa16.87■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 RABIFP47224 123 aa16.87■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 ACTA2P62736 377 aa16.87■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 ACTG2P63267 376 aa16.87■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF542PQ5EBM4 170 aa16.87■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 PYHIN1Q6K0P9 492 aa16.87■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM92Q6UXU6 159 aa16.87■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 TAF8Q7Z7C8 310 aa16.87■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa16.87■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP16.87■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 PIAS3Q9Y6X2 628 aa16.87■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 MYO9BQ13459 2157 aa16.86■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa16.86■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 HCRTR1O43613 425 aa16.86■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 FZD7O75084 574 aa16.86■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 NDUFB2O95178 105 aa16.86■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 DRD1P21728 446 aa16.86■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
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SYNE4-204ENST00000465425 SHHQ15465 462 aa16.86■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 TP53I3Q53FA7 332 aa16.86■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 YIF1BQ5BJH7 314 aa16.86■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 GPR135Q8IZ08 494 aa16.86■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 OR13C5Q8NGS8 318 aa16.86■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 THAP4Q8WY91 577 aa16.86■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 TRIM63Q969Q1 353 aa16.86■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 SLC28A3Q9HAS3 691 aa16.86■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa16.86■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 OR5K3A6NET4 321 aa16.86■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 ARHGEF9O43307 516 aa16.86■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 IGKV1D-16P01601 117 aa16.86■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 C1QBP02746 253 aa16.86■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 HHEXQ03014 270 aa16.86■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa16.86■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa16.86■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 OR51L1Q8NGJ5 315 aa16.86■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 SNX33Q8WV41 574 aa16.86■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 LRFN5Q96NI6 719 aa16.86■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 NIPAL2Q9H841 368 aa16.86■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 FAM60AQ9NP50 221 aa16.86■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 TEKT2Q9UIF3 430 aa16.86■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 SERTAD3Q9UJW9 196 aa16.86■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa16.86■□□□□ 0.29
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SYNE4-204ENST00000465425 SEMA4FO95754 770 aa16.85■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 OR2T7P0C7T2 308 aa16.85■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 ST6GAL1P15907 406 aa16.85■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 S1PR1P21453 382 aa16.85■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 RPL4P36578 427 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 GZMKP49863 264 aa16.85■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 GPR143P51810 404 aa16.85■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 HCCSP53701 268 aa16.85■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 MAB21L1Q13394 359 aa16.85■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 ARL14Q8N4G2 192 aa16.85■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 RFLNBQ8N5W9 214 aa16.85■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 TEX19Q8NA77 164 aa16.85■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 POMGNT2Q8NAT1 580 aa16.85■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 OR2T27Q8NH04 317 aa16.85■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 ZFAND1Q8TCF1 268 aa16.85■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 GALNT9Q9HCQ5 603 aa16.85■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 Q9N2J8 555 aa16.85■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 HCN3Q9P1Z3 774 aa16.85■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 CHRNA9Q9UGM1 479 aa16.85■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa16.85■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 CLEC4AQ9UMR7 237 aa16.85■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa16.85■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 CACNG2Q9Y698 323 aa16.85■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 MAU2Q9Y6X3 613 aa16.85■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 A0A1W2PPK0 400 aa16.85■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 ARL6IP5O75915 188 aa16.85■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 AHCYP23526 432 aa16.85■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 GDI2P50395 445 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 FHL1Q13642 323 aa16.85■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 FAM53BQ14153 422 aa16.85■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 FGFBP1Q14512 234 aa16.85■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 Q5BKY6 102 aa16.85■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 KIRREL2Q6UWL6 708 aa16.85■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 LIX1LQ8IVB5 337 aa16.85■□□□□ 0.29
SYNE4-204ENST00000465425 SMIM19Q96E16 107 aa16.85■□□□□ 0.29
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