RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463372.5

C9orf3-211, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 919 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-211ENST00000463372 SLC29A2Q14542 456 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 TECRLQ5HYJ1 363 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 LIPJQ5W064 366 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 TUBA1AQ71U36 451 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 PEX26Q7Z412 305 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 FAM169BQ8N8A8 192 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 PDPRQ8NCN5 879 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 OR4C3Q8NH37 302 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 PIGXQ8TBF5 258 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 ITPKCQ96DU7 683 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 BOD1Q96IK1 185 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 C16orf95Q9H693 158 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 DNAH7Q8WXX0 4024 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 TRIM49D1C9J1S8 452 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 E9PQ18 207 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 K7EPI3 171 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 IGKV1D-16P01601 117 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 CELA3BP08861 270 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 GABRA3P34903 492 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 CRYBB2P43320 205 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 CCL8P80075 99 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 EGR3Q06889 387 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 CRYMQ14894 314 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 C3orf33Q6P1S2 294 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 PGBD2Q6P3X8 592 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 Q6ZSV7 163 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 FAM9CQ8IZT9 166 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 OR10S1Q8NGN2 331 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 TBC1D15Q8TC07 691 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 SSMEM1Q8WWF3 244 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 EXT2Q93063 718 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 TM4SF18Q96CE8 201 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 SIGLEC10Q96LC7 697 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 DERL2Q9GZP9 239 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 CENPHQ9H3R5 247 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 NOX3Q9HBY0 568 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 GIMAP4Q9NUV9 329 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 NOX1Q9Y5S8 564 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa11.29□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 A0A1W2PPW3 197 aa11.29□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 NR5A2O00482 541 aa11.29□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 SCDO00767 359 aa11.29□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 H6PDO95479 791 aa11.29□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 ESRRBO95718 433 aa11.29□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 IGKV3-15P01624 115 aa11.29□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 MELTFP08582 738 aa11.29□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 TPM1P09493 284 aa11.29□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 PPIAL4GP0DN37 164 aa11.29□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 LYL1P12980 280 aa11.29□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 PRKCAP17252 672 aa11.29□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 PGAM1P18669 254 aa11.29□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 NR4A1P22736 598 aa11.29□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 MAGEA8P43361 318 aa11.29□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 SLC16A1P53985 500 aa11.29□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 TPM4P67936 248 aa11.29□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 BST1Q10588 318 aa11.29□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 TRADDQ15628 312 aa11.29□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 HFEQ30201 348 aa11.29□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 SEL1L2Q5TEA6 688 aa11.29□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 BRD3OSQ6XYD6 125 aa11.29□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 TMPPEQ6ZT21 453 aa11.29□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 IL17RDQ8NFM7 739 aa11.29□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 OR1K1Q8NGR3 316 aa11.29□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 TOR3AQ9H497 397 aa11.29□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 CRLF2Q9HC73 371 aa11.29□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 NPHS2Q9NP85 383 aa11.29□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 GXYLT2A0PJZ3 443 aa11.28□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 KRT33AO76009 404 aa11.28□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 F13BP05160 661 aa11.28□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 MPIP34949 423 aa11.28□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 MAGEA6P43360 314 aa11.28□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF117Q03924 483 aa11.28□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 NPRL3Q12980 569 aa11.28□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 MSMPQ1L6U9 139 aa11.28□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 C1orf174Q8IYL3 243 aa11.28□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP11.28□□□□□ -0.65e-11■■■■■ 61.5
C9orf3-211ENST00000463372 TEX9Q8N6V9 391 aa11.28□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 LRRC39Q96DD0 335 aa11.28□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
C9orf3-211ENST00000463372 A0A087WV62 115 aa11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms