RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 PTNP21246 168 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 GALP22466 123 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 NOS3P29474 1203 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 UQCRC1P31930 480 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SLC9A3P48764 834 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 PGDP52209 483 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CDH11P55287 796 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 RAB15P59190 212 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 PSPHP78330 225 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CCL7P80098 99 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 LTBQ06643 244 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SIGLEC14Q08ET2 396 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ITGADQ13349 1161 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 NR0B2Q15466 257 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 MED22Q15528 200 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 NNATQ16517 81 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 KIF26BQ2KJY2 2108 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 HLA-BQ31612 363 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF404Q494X3 552 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ALG10BQ5I7T1 473 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ARMC4Q5T2S8 1044 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 LINC01590Q5TEZ4 76 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 OR2G6Q5TZ20 316 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 DESI1Q6ICB0 168 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM205Q6UW68 189 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 LYPD8Q6UX82 237 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 HSDL2Q6YN16 418 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 DBX2Q6ZNG2 339 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 LANCL3Q6ZV70 420 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
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PTPRC-210ENST00000462363 FAM122BQ7Z309 247 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ZBTB46Q86UZ6 589 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CPOQ8IVL8 374 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 GID4Q8IVV7 300 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SLC34A3Q8N130 599 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 AMER2Q8N7J2 671 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM99Q8N816 258 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SLC37A3Q8NCC5 494 aa5.16□□□□□ -1.58
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PTPRC-210ENST00000462363 APCDD1LQ8NCL9 501 aa5.16□□□□□ -1.58
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PTPRC-210ENST00000462363 OR1N1Q8NGS0 311 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 RPS4Y2Q8TD47 263 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 GRHL3Q8TE85 626 aa5.16□□□□□ -1.58
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PTPRC-210ENST00000462363 S100ZQ8WXG8 99 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 RFKQ969G6 155 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 HSPBAP1Q96EW2 488 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
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PTPRC-210ENST00000462363 NDC1Q9BTX1 674 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 LAT2Q9GZY6 243 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ADGRL4Q9HBW9 690 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 NRIP3Q9NQ35 241 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ERVK13-1Q9NX77 482 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 STUB1Q9UNE7 303 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CFL2Q9Y281 166 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ERGIC3Q9Y282 383 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 HIF3AQ9Y2N7 669 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 PCSK5Q92824 1860 aa5.15□□□□□ -1.58
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PTPRC-210ENST00000462363 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa5.15□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 C17orf51A8MQB3 221 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 MCIDASD6RGH6 385 aa5.15□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 PLD2O14939 933 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF264O43296 627 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 LRRTM2O43300 516 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 PPM1BO75688 479 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SC5DO75845 299 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 NDUFB2O95178 105 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 APOL3O95236 402 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 PPP1R3DO95685 299 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 TFP02787 698 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 IFNA16P05015 189 aa5.15□□□□□ -1.59
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