RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435532.7

NEDD4-202, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD4, Length 5,869 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4-202ENST00000435532 ANKRD10Q9NXR5 420 aa14.52□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 TMEM181Q9P2C4 612 aa14.52□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 LRIT2A6NDA9 550 aa14.52□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 NKX6-3A6NJ46 265 aa14.52□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 STSP08842 583 aa14.52□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 CHMP24386 653 aa14.52□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 NDUFAF7Q7L592 441 aa14.52□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 IGFN1Q86VF2 1251 aa14.52□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 MFRPQ9BY79 579 aa14.52□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 EMCNQ9ULC0 261 aa14.52□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 VASNQ6EMK4 673 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 CYB561A3Q8NBI2 242 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 SLC6A7Q99884 636 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 WACQ9BTA9 647 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 NDRG3Q9UGV2 375 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 TRAV27A0A087WT01 109 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 LRRC30A6NM36 301 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 SSTR4P31391 388 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 MAGEA3P43357 314 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 TFF2Q03403 129 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 OR51L1Q8NGJ5 315 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 CHTF18Q8WVB6 975 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 MOKQ9UQ07 419 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 TNFSF14O43557 240 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 A4GALTQ9NPC4 353 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 TAS2R8Q9NYW2 309 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 LRFN1Q9P244 771 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 FBP2O00757 339 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 CEACAM5P06731 702 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 CTSLP07711 333 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 CD40LGP29965 261 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 PRKAR1BP31321 381 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 GABRA2P47869 451 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 DNASE1L3Q13609 305 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 PODNL1Q6PEZ8 512 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 LRRC18Q8N456 261 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 TIMD4Q96H15 378 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 PROCRQ9UNN8 238 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 A8MVM7 634 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 GABBR2O75899 941 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 SERPINA5P05154 406 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 TSC22D1Q15714 1073 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 MS4A6EQ96DS6 147 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 ALDOBP05062 364 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 P2RX1P51575 399 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 ACTBP60709 375 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 ACTG1P63261 375 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 HOXC5Q00444 222 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 TMEM205Q6UW68 189 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 EGLN1Q9GZT9 426 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 GLIPR2Q9H4G4 154 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 DAPP1Q9UN19 280 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 MYBPHQ13203 477 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 KEAP1Q14145 624 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 PGGHGQ32M88 737 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 ZNF684Q5T5D7 378 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 BORAQ6PGQ7 559 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 MARCH3Q86UD3 253 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 SLC43A2Q8N370 569 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 CHPT1Q8WUD6 406 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 PATE1Q8WXA2 126 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 SAP130Q9H0E3 1048 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 MMP27Q9H306 513 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 REV1Q9UBZ9 1251 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 HHLA2Q9UM44 414 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 A0A087WUU8 490 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 PRKACBP22694 351 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 GPR176Q14439 515 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 TP53I3Q53FA7 332 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 CMTM1Q8IZ96 169 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 OR5W2Q8NH69 310 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 PIGCQ92535 297 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 J3QRK9 145 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 TAPBPO15533 448 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 STT3AP46977 705 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 NADK2Q4G0N4 442 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 C22orf42Q6IC83 251 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD4-202ENST00000435532 MFSD12Q6NUT3 480 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.6 ms