RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428541.1

AC079305.1-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AC079305.1, Length 499 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC079305.1-201ENST00000428541 GKN3PP0CG01 181 aa24.77■■□□□ 1.56
AC079305.1-201ENST00000428541 ARAFP10398 606 aa24.77■■□□□ 1.56
AC079305.1-201ENST00000428541 GPX2P18283 190 aa24.77■■□□□ 1.56
AC079305.1-201ENST00000428541 TACR3P29371 465 aa24.77■■□□□ 1.56
AC079305.1-201ENST00000428541 GUCY1A3Q02108 690 aa24.77■■□□□ 1.56
AC079305.1-201ENST00000428541 ZNF311Q5JNZ3 666 aa24.77■■□□□ 1.56
AC079305.1-201ENST00000428541 STK32CQ86UX6 486 aa24.77■■□□□ 1.56
AC079305.1-201ENST00000428541 DPP10Q8N608 796 aa24.77■■□□□ 1.56
AC079305.1-201ENST00000428541 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
AC079305.1-201ENST00000428541 IKZF5Q9H5V7 419 aa24.77■■□□□ 1.56
AC079305.1-201ENST00000428541 C12orf49Q9H741 205 aa24.77■■□□□ 1.56
AC079305.1-201ENST00000428541 OSGIN1Q9UJX0 560 aa24.77■■□□□ 1.56
AC079305.1-201ENST00000428541 TMED7Q9Y3B3 224 aa24.77■■□□□ 1.56
AC079305.1-201ENST00000428541 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa24.77■■□□□ 1.56
AC079305.1-201ENST00000428541 CHST2Q9Y4C5 530 aa24.77■■□□□ 1.56
AC079305.1-201ENST00000428541 CASKO14936 926 aa24.76■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 YES1P07947 543 aa24.76■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 CCNA2P20248 432 aa24.76■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 CCKARP32238 428 aa24.76■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 RUNDC3AQ59EK9 446 aa24.76■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 FBXW10Q5XX13 1052 aa24.76■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 BEND4Q6ZU67 534 aa24.76■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 ZNF550Q7Z398 422 aa24.76■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 NFKBIDQ8NI38 313 aa24.76■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 ARL5BQ96KC2 179 aa24.76■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa24.76■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 KLHL4Q9C0H6 718 aa24.76■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 OR11A1Q9GZK7 315 aa24.76■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 KLHL9Q9P2J3 617 aa24.76■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 CYTIPO60759 359 aa24.75■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 PMS2P2O95744 297 aa24.75■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 FESP07332 822 aa24.75■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 ETS2P15036 469 aa24.75■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 MAP2K6P52564 334 aa24.75■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 ARFIP2P53365 341 aa24.75■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 REEP3Q6NUK4 255 aa24.75■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 DHDDSQ86SQ9 333 aa24.75■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 RETREG3Q86VR2 466 aa24.75■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 CDC20BQ86Y33 519 aa24.75■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 PSD2Q9BQI7 771 aa24.75■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 ADAM19Q9H013 955 aa24.75■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 CCDC134Q9H6E4 229 aa24.75■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 TMEM38AQ9H6F2 299 aa24.75■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 BCO1Q9HAY6 547 aa24.75■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 FANCFQ9NPI8 374 aa24.75■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 KLHL28Q9NXS3 571 aa24.75■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 CREBBPQ92793 2442 aa24.75■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 ZNF208O43345 1280 aa24.74■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 KLK2P20151 261 aa24.74■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 CDK6Q00534 326 aa24.74■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa24.74■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 CGB2Q6NT52 195 aa24.74■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 LURAP1LQ8IV03 231 aa24.74■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 NRGNQ92686 78 aa24.74■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 DDIT4LQ96D03 193 aa24.74■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 MED18Q9BUE0 208 aa24.74■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa24.74■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 TMEM72A0PK05 275 aa24.73■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 PRG2P13727 222 aa24.73■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 COPZ1P61923 177 aa24.73■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 WBP2NLQ6ICG8 309 aa24.73■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa24.73■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 DNAJA3Q96EY1 480 aa24.73■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 ANKRD27Q96NW4 1050 aa24.73■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 MRGBPQ9NV56 204 aa24.73■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 ZNF226Q9NYT6 803 aa24.73■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 TRAPPC4Q9Y296 219 aa24.73■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 ATP8B1O43520 1251 aa24.72■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 DNPH1O43598 174 aa24.72■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 SCARB2Q14108 478 aa24.72■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 ADRM1Q16186 407 aa24.72■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 TFAP2EQ6VUC0 442 aa24.72■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 STAC2Q6ZMT1 411 aa24.72■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 SERPINA11Q86U17 422 aa24.72■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 KRT73Q86Y46 540 aa24.72■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 CADM2Q8N3J6 435 aa24.72■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 SLC35B4Q969S0 331 aa24.72■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 CGREF1Q99674 301 aa24.72■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 TMEM181Q9P2C4 612 aa24.72■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 MPDZO75970 2070 aa24.72■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 HRGP04196 525 aa24.71■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 SLC6A2P23975 617 aa24.71■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 CXCR1P25024 350 aa24.71■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 PRKAR1BP31321 381 aa24.71■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 OR2B6P58173 313 aa24.71■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 NFYCQ13952 458 aa24.71■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 ANKRD34AQ69YU3 496 aa24.71■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa24.71■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 POLQO75417 2590 aa24.71■■□□□ 1.55
AC079305.1-201ENST00000428541 ZNF724A8MTY0 619 aa24.7■■□□□ 1.54
AC079305.1-201ENST00000428541 MDH1P40925 334 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
AC079305.1-201ENST00000428541 PDK3Q15120 406 aa24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms