RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417985.1

ACTBP1-201, Transcript of actin, beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP1, Length 1,113 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP1-201ENST00000417985 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
ACTBP1-201ENST00000417985 TWIST2Q8WVJ9 160 aa10.15□□□□□ -0.78
ACTBP1-201ENST00000417985 DNAJA3Q96EY1 480 aa10.15□□□□□ -0.78
ACTBP1-201ENST00000417985 BOD1Q96IK1 185 aa10.15□□□□□ -0.78
ACTBP1-201ENST00000417985 C3orf30Q96M34 536 aa10.15□□□□□ -0.78
ACTBP1-201ENST00000417985 OR11A1Q9GZK7 315 aa10.15□□□□□ -0.78
ACTBP1-201ENST00000417985 ZNF350Q9GZX5 532 aa10.15□□□□□ -0.78
ACTBP1-201ENST00000417985 SLC17A5Q9NRA2 495 aa10.15□□□□□ -0.78
ACTBP1-201ENST00000417985 CTPS2Q9NRF8 586 aa10.15□□□□□ -0.78
ACTBP1-201ENST00000417985 SERINC1Q9NRX5 453 aa10.15□□□□□ -0.78
ACTBP1-201ENST00000417985 SLC7A10Q9NS82 523 aa10.15□□□□□ -0.78
ACTBP1-201ENST00000417985 KCNS2Q9ULS6 477 aa10.15□□□□□ -0.78
ACTBP1-201ENST00000417985 ATP23Q9Y6H3 246 aa10.15□□□□□ -0.78
ACTBP1-201ENST00000417985 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 NDUFS8O00217 210 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 DNPH1O43598 174 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 CYP7B1O75881 506 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 CSTAP01040 98 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 SHBGP04278 402 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 PGCP20142 388 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 CCT5P48643 541 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 PDLIM4P50479 330 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 GGTLC2Q14390 218 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 GPR68Q15743 365 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 TSPO2Q5TGU0 170 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 CLEC4FQ8N1N0 589 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 DEPDC4Q8N2C3 294 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 C17orf78Q8N4C9 275 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 PIGXQ8TBF5 258 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 TMEM234Q8WY98 164 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 ARL8AQ96BM9 186 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 ZG16BQ96DA0 208 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 C1orf159Q96HA4 380 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 FOXN4Q96NZ1 517 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 TRMOQ9BU70 441 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 CHRNA9Q9UGM1 479 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 DCTN4Q9UJW0 460 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 MKLN1Q9UL63 735 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 TMEM114B3SHH9 223 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 GPR171O14626 319 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 KIAA0513O60268 411 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 TRIM13O60858 407 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 PEX11AO75192 247 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 STX11O75558 287 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 PGRP06401 933 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 GUSBP08236 651 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 IMPDH2P12268 514 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 DDX5P17844 614 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 ARRB2P32121 409 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 RPL3P39023 403 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 CHRNB3Q05901 458 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 FUT5Q11128 374 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 ZSWIM7Q19AV6 140 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 SPDYE7PQ495Y7 208 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 C6orf136Q5SQH8 315 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 C9orf135Q5VTT2 229 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 EMBQ6PCB8 327 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 GRINAQ7Z429 371 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 DDIASQ8IXT1 998 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 CNPY4Q8N129 248 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 NATD1Q8N6N6 113 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 ZIC4Q8N9L1 334 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 MIPOL1Q8TD10 442 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 MOAP1Q96BY2 351 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 FBXO17Q96EF6 278 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 PPP3R2Q96LZ3 170 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 C1orf50Q9BV19 199 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 SAP130Q9H0E3 1048 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 FKRPQ9H9S5 495 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 MOKQ9UQ07 419 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 AMDHD2Q9Y303 409 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa10.12□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa10.12□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa10.12□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 DUXAA6NLW8 204 aa10.12□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 WIPF1O43516 503 aa10.12□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 CHEK2O96017 543 aa10.12□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 AK1P00568 194 aa10.12□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 TFPIP10646 304 aa10.12□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 BMP4P12644 408 aa10.12□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 APEHP13798 732 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 ZNF23P17027 643 aa10.12□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 MATN1P21941 496 aa10.12□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 MAPK1P28482 360 aa10.12□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 CLK1P49759 484 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 SLC17A1Q14916 467 aa10.12□□□□□ -0.79
ACTBP1-201ENST00000417985 CR1LQ2VPA4 569 aa10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms