RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402934.5

LTBP1-201, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene LTBP1, Length 4,948 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP1-201ENST00000402934 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 ZNF439Q8NDP4 499 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 OR56B1Q8NGI3 324 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 CD200R1Q8TD46 325 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 MIB2Q96AX9 1013 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 RSPRY1Q96DX4 576 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 INPP5KQ9BT40 448 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 OR52D1Q9H346 318 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 WASH6PQ9NQA3 447 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 NENFQ9UMX5 172 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 CA5BQ9Y2D0 317 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 HEPACAM2A8MVW5 462 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 F6UZH7 168 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 CACNG3O60359 315 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 TPPPO94811 219 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 CRHBPP24387 322 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 MAGEB1P43366 347 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 TSFMP43897 325 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 GIPRP48546 466 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 ZNF92Q03936 586 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 RUNX3Q13761 415 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 PLPP5Q8NEB5 264 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 PHYHIPQ92561 330 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 SLAMF9Q96A28 289 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 LIN7BQ9HAP6 207 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 SLC6A20Q9NP91 592 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 COQ3Q9NZJ6 369 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 VAPAQ9P0L0 249 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 ZNF281Q9Y2X9 895 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 TRAPPC2LH3BP13 241 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 SNCAP37840 140 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 MC3RP41968 323 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 TM4SF4P48230 202 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 LTBQ06643 244 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 ACSM1Q08AH1 577 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 PLA2G7Q13093 441 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 GPR18Q14330 331 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 SLC22A6Q4U2R8 563 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 ESCO2Q56NI9 601 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 ZNF691Q5VV52 312 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 SBSNQ6UWP8 590 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 AMDHD1Q96NU7 426 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 OR5B2Q96R09 309 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 OCSTAMPQ9BR26 566 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 CRB3Q9BUF7 120 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 KLK4Q9Y5K2 254 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 PHIPQ8WWQ0 1821 aa8□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 HIDE1A8MVS5 230 aa7.99□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa7.99□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 FAM227AF5H4B4 570 aa7.99□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 IQCF3P0C7M6 154 aa7.99□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 BCKDHBP21953 392 aa7.99□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 SERPINF1P36955 418 aa7.99□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 RPS18P62269 152 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 SLC14A2Q15849 920 aa7.99□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 WBP2NLQ6ICG8 309 aa7.99□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 USP53Q70EK8 1073 aa7.99□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 WDR5BQ86VZ2 330 aa7.99□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa7.99□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 PARP16Q8N5Y8 322 aa7.99□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 SLC30A7Q8NEW0 376 aa7.99□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 SDR9C7Q8NEX9 313 aa7.99□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 NPRL2Q8WTW4 380 aa7.99□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 DNAJA3Q96EY1 480 aa7.99□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 C4orf36Q96KX1 117 aa7.99□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 METTL9Q9H1A3 318 aa7.99□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 C1orf123Q9NWV4 160 aa7.99□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 EHFQ9NZC4 300 aa7.99□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 POLHQ9Y253 713 aa7.99□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa7.99□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 CEPT1Q9Y6K0 416 aa7.99□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 KAT6AQ92794 2004 aa7.99□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa7.99□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 A0A0G2JNG1 304 aa7.99□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 TMEM82A0PJX8 343 aa7.99□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 MROH6A6NGR9 719 aa7.99□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 KIR2DS3K7RE56 304 aa7.99□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 HPGDSO60760 199 aa7.99□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 IGHG1P01857 330 aa7.99□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 CD79AP11912 226 aa7.99□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 TNFRSF1BP20333 461 aa7.99□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 PRPH2P23942 346 aa7.99□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 HLA-DMAP28067 261 aa7.99□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 VIPR2P41587 438 aa7.99□□□□□ -1.13
LTBP1-201ENST00000402934 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms