RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393028.5

GIPC1-202, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,483 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-202ENST00000393028 GFRA1P56159 465 aa25.47■■□□□ 1.67
GIPC1-202ENST00000393028 TRAM2Q15035 370 aa25.47■■□□□ 1.67
GIPC1-202ENST00000393028 RCN1Q15293 331 aa25.47■■□□□ 1.67
GIPC1-202ENST00000393028 ATP6AP1Q15904 470 aa25.47■■□□□ 1.67
GIPC1-202ENST00000393028 AAGABQ6PD74 315 aa25.47■■□□□ 1.67
GIPC1-202ENST00000393028 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
GIPC1-202ENST00000393028 DNAJA3Q96EY1 480 aa25.47■■□□□ 1.67
GIPC1-202ENST00000393028 PKP2Q99959 881 aa25.47■■□□□ 1.67
GIPC1-202ENST00000393028 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa25.47■■□□□ 1.67
GIPC1-202ENST00000393028 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa25.47■■□□□ 1.67
GIPC1-202ENST00000393028 A0A087WUJ7 227 aa25.46■■□□□ 1.67
GIPC1-202ENST00000393028 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa25.46■■□□□ 1.67
GIPC1-202ENST00000393028 GNGT2O14610 69 aa25.46■■□□□ 1.67
GIPC1-202ENST00000393028 CLOCKO15516 846 aa25.46■■□□□ 1.67
GIPC1-202ENST00000393028 THRBP10828 461 aa25.46■■□□□ 1.67
GIPC1-202ENST00000393028 PNMTP11086 282 aa25.46■■□□□ 1.67
GIPC1-202ENST00000393028 FASP25445 335 aa25.46■■□□□ 1.67
GIPC1-202ENST00000393028 SHC1P29353 583 aa25.46■■□□□ 1.67
GIPC1-202ENST00000393028 HSF1Q00613 529 aa25.46■■□□□ 1.67
GIPC1-202ENST00000393028 SELENBP1Q13228 472 aa25.46■■□□□ 1.67
GIPC1-202ENST00000393028 DCST1Q5T197 706 aa25.46■■□□□ 1.67
GIPC1-202ENST00000393028 NEIL3Q8TAT5 605 aa25.46■■□□□ 1.67
GIPC1-202ENST00000393028 OR11A1Q9GZK7 315 aa25.46■■□□□ 1.67
GIPC1-202ENST00000393028 REEP1Q9H902 201 aa25.46■■□□□ 1.67
GIPC1-202ENST00000393028 C12orf10Q9HB07 376 aa25.46■■□□□ 1.67
GIPC1-202ENST00000393028 SPRR3Q9UBC9 169 aa25.46■■□□□ 1.67
GIPC1-202ENST00000393028 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa25.46■■□□□ 1.67
GIPC1-202ENST00000393028 DNAJB9Q9UBS3 223 aa25.46■■□□□ 1.67
GIPC1-202ENST00000393028 PRDM4Q9UKN5 801 aa25.46■■□□□ 1.67
GIPC1-202ENST00000393028 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
GIPC1-202ENST00000393028 GTF3C1Q12789 2109 aa25.46■■□□□ 1.67
GIPC1-202ENST00000393028 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa25.45■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 ZNHIT1O43257 154 aa25.45■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 LDLRP01130 860 aa25.45■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 IGHG3P01860 377 aa25.45■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 FCGR1AP12314 374 aa25.45■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 ELK4P28324 431 aa25.45■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 STARP49675 285 aa25.45■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP25.45■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 LAPTM4AQ15012 233 aa25.45■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa25.45■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 C3orf33Q6P1S2 294 aa25.45■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 SLC7A13Q8TCU3 470 aa25.45■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa25.45■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 ASF1BQ9NVP2 202 aa25.45■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 COL6A6A6NMZ7 2263 aa25.44■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 SHANK1Q9Y566 2161 aa25.44■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 A0A1W2PRQ8 180 aa25.44■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 TNFRSF11BO00300 401 aa25.44■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 PIP5K1CO60331 668 aa25.44■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 SFTPDP35247 375 aa25.44■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 UGT2B15P54855 530 aa25.44■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 DGCR6Q14129 220 aa25.44■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 SEC23BQ15437 767 aa25.44■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 LINC00114Q6XXX2 140 aa25.44■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 ZGRF1Q86YA3 2104 aa25.44■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 FAR1Q8WVX9 515 aa25.44■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 MPP4Q96JB8 637 aa25.44■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 TTLL8A6PVC2 850 aa25.43■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 BAG2O95816 211 aa25.43■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 PODNL1Q6PEZ8 512 aa25.43■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 TBPL2Q6SJ96 375 aa25.43■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa25.43■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 OR4C15Q8NGM1 316 aa25.43■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 FUZQ9BT04 418 aa25.43■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 NTN4Q9HB63 628 aa25.43■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 SERINC1Q9NRX5 453 aa25.43■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 HCN1O60741 890 aa25.42■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 BMP7P18075 431 aa25.42■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 CHMP24386 653 aa25.42■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 LIMS1P48059 325 aa25.42■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 SMIM11AP58511 58 aa25.42■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 EGR4Q05215 589 aa25.42■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP25.42■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 PFN4Q8NHR9 129 aa25.42■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 TMEM239Q8WW34 195 aa25.42■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 GPR137Q96N19 417 aa25.42■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 ALPK1Q96QP1 1244 aa25.42■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF426Q9BUY5 554 aa25.42■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 ANKRD19PQ9H560 264 aa25.42■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 A0A087WUU8 490 aa25.41■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 E2F6O75461 281 aa25.41■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 TFPIP10646 304 aa25.41■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 GCKP35557 465 aa25.41■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 C19orf57Q0VDD7 668 aa25.41■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 SYT14P1Q58G82 188 aa25.41■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 C1QL3Q5VWW1 255 aa25.41■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF730Q6ZMV8 503 aa25.41■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 UBQLNLQ8IYU4 475 aa25.41■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 PQLC1Q8N2U9 271 aa25.41■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
GIPC1-202ENST00000393028 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms