RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380750.7

SERF1B-201, Transcript of small EDRK-rich factor 1B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SERF1B, Length 1,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1B-201ENST00000380750 MED22Q15528 200 aa22.18■■□□□ 1.14
SERF1B-201ENST00000380750 ARMCX4Q5H9R4 360 aa22.18■■□□□ 1.14
SERF1B-201ENST00000380750 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa22.18■■□□□ 1.14
SERF1B-201ENST00000380750 DEPDC7Q96QD5 511 aa22.18■■□□□ 1.14
SERF1B-201ENST00000380750 CLEC2DQ9UHP7 191 aa22.18■■□□□ 1.14
SERF1B-201ENST00000380750 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SERF1B-201ENST00000380750 C17orf51A8MQB3 221 aa22.17■■□□□ 1.14
SERF1B-201ENST00000380750 ADAM10O14672 748 aa22.17■■□□□ 1.14
SERF1B-201ENST00000380750 OR7A10O76100 309 aa22.17■■□□□ 1.14
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SERF1B-201ENST00000380750 TACR3P29371 465 aa22.17■■□□□ 1.14
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SERF1B-201ENST00000380750 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa22.17■■□□□ 1.14
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SERF1B-201ENST00000380750 CPOQ8IVL8 374 aa22.17■■□□□ 1.14
SERF1B-201ENST00000380750 MISPQ8IVT2 679 aa22.17■■□□□ 1.14
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SERF1B-201ENST00000380750 MYOTQ9UBF9 498 aa22.17■■□□□ 1.14
SERF1B-201ENST00000380750 ZNF337Q9Y3M9 751 aa22.17■■□□□ 1.14
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SERF1B-201ENST00000380750 SPCS2Q15005 226 aa22.17■■□□□ 1.14
SERF1B-201ENST00000380750 C3orf38Q5JPI3 329 aa22.17■■□□□ 1.14
SERF1B-201ENST00000380750 LRRC17Q8N6Y2 441 aa22.17■■□□□ 1.14
SERF1B-201ENST00000380750 NANOGP1Q8N7R0 232 aa22.17■■□□□ 1.14
SERF1B-201ENST00000380750 PROKR2Q8NFJ6 384 aa22.17■■□□□ 1.14
SERF1B-201ENST00000380750 BBS1Q8NFJ9 593 aa22.17■■□□□ 1.14
SERF1B-201ENST00000380750 OR5M3Q8NGP4 307 aa22.17■■□□□ 1.14
SERF1B-201ENST00000380750 OR2Y1Q8NGV0 311 aa22.17■■□□□ 1.14
SERF1B-201ENST00000380750 HGDQ93099 445 aa22.17■■□□□ 1.14
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SERF1B-201ENST00000380750 TMEM9BQ9NQ34 198 aa22.17■■□□□ 1.14
SERF1B-201ENST00000380750 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SERF1B-201ENST00000380750 LRRN3E7EW58 273 aa22.16■■□□□ 1.14
SERF1B-201ENST00000380750 SLC22A1O15245 554 aa22.16■■□□□ 1.14
SERF1B-201ENST00000380750 GMFGO60234 142 aa22.16■■□□□ 1.14
SERF1B-201ENST00000380750 PPP1R3DO95685 299 aa22.16■■□□□ 1.14
SERF1B-201ENST00000380750 RAB11FIP2Q7L804 512 aa22.16■■□□□ 1.14
SERF1B-201ENST00000380750 GID4Q8IVV7 300 aa22.16■■□□□ 1.14
SERF1B-201ENST00000380750 ELP5Q8TE02 316 aa22.16■■□□□ 1.14
SERF1B-201ENST00000380750 ZPBPQ9BS86 351 aa22.16■■□□□ 1.14
SERF1B-201ENST00000380750 TAPBPLQ9BX59 468 aa22.16■■□□□ 1.14
SERF1B-201ENST00000380750 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa22.15■■□□□ 1.14
SERF1B-201ENST00000380750 FAM183AA6NL82 134 aa22.15■■□□□ 1.14
SERF1B-201ENST00000380750 STK17BO94768 372 aa22.15■■□□□ 1.14
SERF1B-201ENST00000380750 NUDT14O95848 222 aa22.15■■□□□ 1.14
SERF1B-201ENST00000380750 HSMCR30P0CW71 290 aa22.15■■□□□ 1.14
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SERF1B-201ENST00000380750 DUSP19Q8WTR2 217 aa22.15■■□□□ 1.14
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SERF1B-201ENST00000380750 ZNF700Q9H0M5 742 aa22.15■■□□□ 1.14
SERF1B-201ENST00000380750 TTC28Q96AY4 2481 aa22.15■■□□□ 1.14
SERF1B-201ENST00000380750 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
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SERF1B-201ENST00000380750 BCL10O95999 233 aa22.15■■□□□ 1.14
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SERF1B-201ENST00000380750 BTBD16Q32M84 506 aa22.15■■□□□ 1.14
SERF1B-201ENST00000380750 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SERF1B-201ENST00000380750 NUP54Q7Z3B4 507 aa22.15■■□□□ 1.14
SERF1B-201ENST00000380750 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa22.15■■□□□ 1.14
SERF1B-201ENST00000380750 TTC9Q92623 222 aa22.15■■□□□ 1.14
SERF1B-201ENST00000380750 CDC6Q99741 560 aa22.15■■□□□ 1.14
SERF1B-201ENST00000380750 DEFB126Q9BYW3 111 aa22.15■■□□□ 1.14
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SERF1B-201ENST00000380750 SOCS6O14544 535 aa22.14■■□□□ 1.13
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SERF1B-201ENST00000380750 MYL12AP19105 171 aa22.14■■□□□ 1.13
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SERF1B-201ENST00000380750 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa22.14■■□□□ 1.13
SERF1B-201ENST00000380750 NOS3P29474 1203 aa22.13■■□□□ 1.13
SERF1B-201ENST00000380750 ETV1P50549 477 aa22.13■■□□□ 1.13
SERF1B-201ENST00000380750 NIPAL3Q6P499 406 aa22.13■■□□□ 1.13
SERF1B-201ENST00000380750 PAQR6Q6TCH4 344 aa22.13■■□□□ 1.13
SERF1B-201ENST00000380750 LYPD8Q6UX82 237 aa22.13■■□□□ 1.13
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