RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379215.8

ECHDC3-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHDC3, Length 1,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-201ENST00000379215 WASF3Q9UPY6 502 aa22.31■■□□□ 1.16
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ECHDC3-201ENST00000379215 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa22.3■■□□□ 1.16
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ECHDC3-201ENST00000379215 LYNP07948 512 aa22.3■■□□□ 1.16
ECHDC3-201ENST00000379215 MAKP20794 623 aa22.3■■□□□ 1.16
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ECHDC3-201ENST00000379215 CASP12Q6UXS9 341 aa22.29■■□□□ 1.16
ECHDC3-201ENST00000379215 FANK1Q8TC84 345 aa22.29■■□□□ 1.16
ECHDC3-201ENST00000379215 KLHDC3Q9BQ90 382 aa22.29■■□□□ 1.16
ECHDC3-201ENST00000379215 ANKRD10Q9NXR5 420 aa22.29■■□□□ 1.16
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ECHDC3-201ENST00000379215 ST13P50502 369 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
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ECHDC3-201ENST00000379215 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
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ECHDC3-201ENST00000379215 OR2T33Q8NG76 320 aa22.27■■□□□ 1.16
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ECHDC3-201ENST00000379215 SIGLEC7Q9Y286 467 aa22.27■■□□□ 1.16
ECHDC3-201ENST00000379215 CFAP54Q96N23 3096 aa22.27■■□□□ 1.15
ECHDC3-201ENST00000379215 B4DXG7 233 aa22.26■■□□□ 1.15
ECHDC3-201ENST00000379215 WDPCPO95876 746 aa22.26■■□□□ 1.15
ECHDC3-201ENST00000379215 MT-ATP6P00846 226 aa22.26■■□□□ 1.15
ECHDC3-201ENST00000379215 CXCR4P61073 352 aa22.26■■□□□ 1.15
ECHDC3-201ENST00000379215 CSNK2BP67870 215 aa22.26■■□□□ 1.15
ECHDC3-201ENST00000379215 OR1C1Q15619 314 aa22.26■■□□□ 1.15
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF74Q16587 644 aa22.26■■□□□ 1.15
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