RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 HEXDCQ8WVB3 486 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 PYCR2Q96C36 320 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 TUBGCP3Q96CW5 907 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 VPS39Q96JC1 886 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 C10orf90Q96M02 699 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 CASD1Q96PB1 797 aa3.16□□□□□ -1.9
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PTPRC-202ENST00000367364 CCM2Q9BSQ5 444 aa3.16□□□□□ -1.9
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PTPRC-202ENST00000367364 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 U3KQV3 271 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF541Q9H0D2 1346 aa3.16□□□□□ -1.9
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PTPRC-202ENST00000367364 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
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PTPRC-202ENST00000367364 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-202ENST00000367364 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa3.15□□□□□ -1.91
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PTPRC-202ENST00000367364 CCDC182A6NF36 153 aa3.15□□□□□ -1.91
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PTPRC-202ENST00000367364 MRASO14807 208 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-202ENST00000367364 PHYHO14832 338 aa3.15□□□□□ -1.91
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PTPRC-202ENST00000367364 OR4F21O95013 312 aa3.15□□□□□ -1.91
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PTPRC-202ENST00000367364 PMELP40967 661 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-202ENST00000367364 CSKP41240 450 aa3.15□□□□□ -1.91
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