RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357325.9

HDGF-201, Transcript of heparin binding growth factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGF, Length 2,380 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGF-201ENST00000357325 A0A0G2JNG1 304 aa22.94■■□□□ 1.26
HDGF-201ENST00000357325 KIR2DS3K7RE56 304 aa22.94■■□□□ 1.26
HDGF-201ENST00000357325 STX4Q12846 297 aa22.94■■□□□ 1.26
HDGF-201ENST00000357325 KIR2DS5Q14953 304 aa22.94■■□□□ 1.26
HDGF-201ENST00000357325 HBMQ6B0K9 141 aa22.94■■□□□ 1.26
HDGF-201ENST00000357325 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa22.94■■□□□ 1.26
HDGF-201ENST00000357325 SAMD12Q8N8I0 201 aa22.94■■□□□ 1.26
HDGF-201ENST00000357325 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
HDGF-201ENST00000357325 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa22.94■■□□□ 1.26
HDGF-201ENST00000357325 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
HDGF-201ENST00000357325 KCNN2Q9H2S1 579 aa22.94■■□□□ 1.26
HDGF-201ENST00000357325 KLHL1Q9NR64 748 aa22.94■■□□□ 1.26
HDGF-201ENST00000357325 MMP17Q9ULZ9 603 aa22.94■■□□□ 1.26
HDGF-201ENST00000357325 CLEC4AQ9UMR7 237 aa22.94■■□□□ 1.26
HDGF-201ENST00000357325 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
HDGF-201ENST00000357325 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa22.94■■□□□ 1.26
HDGF-201ENST00000357325 ALG5Q9Y673 324 aa22.94■■□□□ 1.26
HDGF-201ENST00000357325 CENPXA8MT69 81 aa22.94■■□□□ 1.26
HDGF-201ENST00000357325 HK1P19367 917 aa22.94■■□□□ 1.26
HDGF-201ENST00000357325 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
HDGF-201ENST00000357325 Q5BKY6 102 aa22.94■■□□□ 1.26
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HDGF-201ENST00000357325 DEFB119Q8N690 84 aa22.94■■□□□ 1.26
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HDGF-201ENST00000357325 C7orf57Q8NEG2 295 aa22.94■■□□□ 1.26
HDGF-201ENST00000357325 GHSRQ92847 366 aa22.94■■□□□ 1.26
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HDGF-201ENST00000357325 OR2B2Q9GZK3 357 aa22.94■■□□□ 1.26
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HDGF-201ENST00000357325 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa22.94■■□□□ 1.26
HDGF-201ENST00000357325 FAM221BA6H8Z2 402 aa22.93■■□□□ 1.26
HDGF-201ENST00000357325 C10orf142B7Z368 130 aa22.93■■□□□ 1.26
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HDGF-201ENST00000357325 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
HDGF-201ENST00000357325 SFXN4Q6P4A7 337 aa22.93■■□□□ 1.26
HDGF-201ENST00000357325 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
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HDGF-201ENST00000357325 C14orf105Q9NVL8 296 aa22.93■■□□□ 1.26
HDGF-201ENST00000357325 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa22.93■■□□□ 1.26
HDGF-201ENST00000357325 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
HDGF-201ENST00000357325 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
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HDGF-201ENST00000357325 CT45A2Q5DJT8 189 aa22.93■■□□□ 1.26
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HDGF-201ENST00000357325 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa22.92■■□□□ 1.26
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HDGF-201ENST00000357325 C16orf52Q8NHV5 167 aa22.92■■□□□ 1.26
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HDGF-201ENST00000357325 SLC6A6P31641 620 aa22.91■■□□□ 1.26
HDGF-201ENST00000357325 RIN1Q13671 783 aa22.91■■□□□ 1.26
HDGF-201ENST00000357325 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
HDGF-201ENST00000357325 PRTGQ2VWP7 1150 aa22.91■■□□□ 1.26
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HDGF-201ENST00000357325 OR4D9Q8NGE8 314 aa22.91■■□□□ 1.26
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HDGF-201ENST00000357325 HDHD2Q9H0R4 259 aa22.91■■□□□ 1.26
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HDGF-201ENST00000357325 NMNAT3Q96T66 252 aa22.91■■□□□ 1.26
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HDGF-201ENST00000357325 FAM171A2A8MVW0 826 aa22.9■■□□□ 1.26
HDGF-201ENST00000357325 PSMD9O00233 223 aa22.9■■□□□ 1.26
HDGF-201ENST00000357325 SLC19A2O60779 497 aa22.9■■□□□ 1.26
HDGF-201ENST00000357325 SRP9P49458 86 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
HDGF-201ENST00000357325 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
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