RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM18Q96B42 140 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 ZBTB8AQ96BR9 441 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 RTL8AQ9BWD3 113 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 KCMF1Q9P0J7 381 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF35P13682 527 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 HOXB2P14652 356 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 TACR3P29371 465 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 BDKRB2P30411 391 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 KIR2DS4P43632 304 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 KIR2DS1Q14954 304 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 FLYWCH1Q4VC44 716 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 ATAD3CQ5T2N8 411 aa4.61□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 OR10K2Q6IF99 312 aa4.61□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 GPR155Q7Z3F1 870 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 ENTHD1Q8IYW4 607 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 GPR26Q8NDV2 337 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 LRR1Q96L50 414 aa4.61□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa4.61□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 RNF19AQ9NV58 838 aa4.61□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 BCHEP06276 602 aa4.61□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 IGDCC3Q8IVU1 814 aa4.61□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 GCNT2Q8N0V5 402 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 FAM26EQ8N5C1 309 aa4.61□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 C16orf70Q9BSU1 422 aa4.61□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 KCNQ1P51787 676 aa4.6□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 S100A10P60903 97 aa4.6□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 KIR2DS5Q14953 304 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 UNC50Q53HI1 259 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 PAGE3Q5JUK9 113 aa4.6□□□□□ -1.67
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