RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354833.7

SERF1A-202, Transcript of small EDRK-rich factor 1A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SERF1A, Length 1,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1A-202ENST00000354833 MED22Q15528 200 aa22.18■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 ARMCX4Q5H9R4 360 aa22.18■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa22.18■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 DEPDC7Q96QD5 511 aa22.18■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 CLEC2DQ9UHP7 191 aa22.18■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 C17orf51A8MQB3 221 aa22.17■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 ADAM10O14672 748 aa22.17■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 OR7A10O76100 309 aa22.17■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 PGCP20142 388 aa22.17■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 TACR3P29371 465 aa22.17■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa22.17■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 CPOQ8IVL8 374 aa22.17■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 MISPQ8IVT2 679 aa22.17■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 MND1Q9BWT6 205 aa22.17■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 MYOTQ9UBF9 498 aa22.17■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 ZNF337Q9Y3M9 751 aa22.17■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 NDUFB2O95178 105 aa22.17■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 HTR1FP30939 366 aa22.17■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 P2RX1P51575 399 aa22.17■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 CBFBQ13951 182 aa22.17■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 SPCS2Q15005 226 aa22.17■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 C3orf38Q5JPI3 329 aa22.17■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 LRRC17Q8N6Y2 441 aa22.17■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 NANOGP1Q8N7R0 232 aa22.17■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 PROKR2Q8NFJ6 384 aa22.17■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 BBS1Q8NFJ9 593 aa22.17■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 OR5M3Q8NGP4 307 aa22.17■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 OR2Y1Q8NGV0 311 aa22.17■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 HGDQ93099 445 aa22.17■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 TMCO6Q96DC7 493 aa22.17■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 MGLLQ99685 303 aa22.17■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 TMEM9BQ9NQ34 198 aa22.17■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 LRRN3E7EW58 273 aa22.16■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 SLC22A1O15245 554 aa22.16■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 GMFGO60234 142 aa22.16■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 PPP1R3DO95685 299 aa22.16■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 RAB11FIP2Q7L804 512 aa22.16■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 GID4Q8IVV7 300 aa22.16■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 ELP5Q8TE02 316 aa22.16■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 ZPBPQ9BS86 351 aa22.16■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 TAPBPLQ9BX59 468 aa22.16■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa22.15■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 FAM183AA6NL82 134 aa22.15■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 STK17BO94768 372 aa22.15■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 NUDT14O95848 222 aa22.15■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 HSMCR30P0CW71 290 aa22.15■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 PEPDP12955 493 aa22.15■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 RGS6P49758 472 aa22.15■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 NUBP1P53384 320 aa22.15■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 ISXQ2M1V0 245 aa22.15■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 PLBD1Q6P4A8 553 aa22.15■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 DUSP19Q8WTR2 217 aa22.15■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 LIPHQ8WWY8 451 aa22.15■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 RACGAP1Q9H0H5 632 aa22.15■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 ZNF700Q9H0M5 742 aa22.15■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 TTC28Q96AY4 2481 aa22.15■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 CSO75390 466 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 BCL10O95999 233 aa22.15■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 EGR4Q05215 589 aa22.15■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 BTBD16Q32M84 506 aa22.15■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 NUP54Q7Z3B4 507 aa22.15■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa22.15■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 TTC9Q92623 222 aa22.15■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 CDC6Q99741 560 aa22.15■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 DEFB126Q9BYW3 111 aa22.15■■□□□ 1.14
SERF1A-202ENST00000354833 RIIAD1A6NNX1 92 aa22.14■■□□□ 1.13
SERF1A-202ENST00000354833 SOCS6O14544 535 aa22.14■■□□□ 1.13
SERF1A-202ENST00000354833 MYL12BO14950 172 aa22.14■■□□□ 1.13
SERF1A-202ENST00000354833 APOL3O95236 402 aa22.14■■□□□ 1.13
SERF1A-202ENST00000354833 GP1BBP13224 206 aa22.14■■□□□ 1.13
SERF1A-202ENST00000354833 MYL12AP19105 171 aa22.14■■□□□ 1.13
SERF1A-202ENST00000354833 HK1P19367 917 aa22.14■■□□□ 1.13
SERF1A-202ENST00000354833 TMED10P49755 219 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SERF1A-202ENST00000354833 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SERF1A-202ENST00000354833 DOC2BQ14184 412 aa22.14■■□□□ 1.13
SERF1A-202ENST00000354833 SPHARQ15513 63 aa22.14■■□□□ 1.13
SERF1A-202ENST00000354833 ZNF74Q16587 644 aa22.14■■□□□ 1.13
SERF1A-202ENST00000354833 CDCP2Q5VXM1 449 aa22.14■■□□□ 1.13
SERF1A-202ENST00000354833 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa22.14■■□□□ 1.13
SERF1A-202ENST00000354833 SUMF1Q8NBK3 374 aa22.14■■□□□ 1.13
SERF1A-202ENST00000354833 GPR119Q8TDV5 335 aa22.14■■□□□ 1.13
SERF1A-202ENST00000354833 RNF138Q8WVD3 245 aa22.14■■□□□ 1.13
SERF1A-202ENST00000354833 OTULINQ96BN8 352 aa22.14■■□□□ 1.13
SERF1A-202ENST00000354833 TAAR9Q96RI9 348 aa22.14■■□□□ 1.13
SERF1A-202ENST00000354833 OSGIN1Q9UJX0 560 aa22.14■■□□□ 1.13
SERF1A-202ENST00000354833 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa22.14■■□□□ 1.13
SERF1A-202ENST00000354833 NOS3P29474 1203 aa22.13■■□□□ 1.13
SERF1A-202ENST00000354833 ETV1P50549 477 aa22.13■■□□□ 1.13
SERF1A-202ENST00000354833 NIPAL3Q6P499 406 aa22.13■■□□□ 1.13
SERF1A-202ENST00000354833 PAQR6Q6TCH4 344 aa22.13■■□□□ 1.13
SERF1A-202ENST00000354833 LYPD8Q6UX82 237 aa22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms