RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa17.42■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 C5orf58C9J3I9 102 aa17.42■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANGPT2O15123 496 aa17.42■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRKD3O94806 890 aa17.42■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 PGM3O95394 542 aa17.42■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 FESP07332 822 aa17.42■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 TFPIP10646 304 aa17.42■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 UQCRBP14927 111 aa17.42■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPX2P18283 190 aa17.42■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 TACR3P29371 465 aa17.42■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC1A3P43003 542 aa17.42■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNJ5P48544 419 aa17.42■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa17.42■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 RUNDC3AQ59EK9 446 aa17.42■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 TUSC5Q8IXB3 177 aa17.42■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC43A2Q8N370 569 aa17.42■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSPEARQ8WU66 669 aa17.42■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSD2Q9BQI7 771 aa17.42■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 C12orf49Q9H741 205 aa17.42■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 GP6Q9HCN6 339 aa17.42■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 CORO2BQ9UQ03 480 aa17.42■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 IFT52Q9Y366 437 aa17.42■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMED7Q9Y3B3 224 aa17.42■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM72A0PK05 275 aa17.41■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 SULT2B1O00204 365 aa17.41■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYTIPO60759 359 aa17.41■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 VIMP08670 466 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRG2P13727 222 aa17.41■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCNA2P20248 432 aa17.41■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARFIP2P53365 341 aa17.41■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDK6Q00534 326 aa17.41■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP17.41■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZSWIM7Q19AV6 140 aa17.41■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF311Q5JNZ3 666 aa17.41■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM201Q5SNT2 666 aa17.41■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa17.41■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNAJA3Q96EY1 480 aa17.41■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM38AQ9H6F2 299 aa17.41■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 BCO1Q9HAY6 547 aa17.41■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa17.41■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 EVPLLA8MZ36 301 aa17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 C16orf97H3BN30 126 aa17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF208O43345 1280 aa17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 PMS2P2O95744 297 aa17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 ETS2P15036 469 aa17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLK1P49759 484 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCARB2Q14108 478 aa17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 SELPLGQ14242 412 aa17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADRM1Q16186 407 aa17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 REEP3Q6NUK4 255 aa17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 TFAP2EQ6VUC0 442 aa17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF550Q7Z398 422 aa17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 SERPINA11Q86U17 422 aa17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKRD27Q96NW4 1050 aa17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 CGREF1Q99674 301 aa17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADAM19Q9H013 955 aa17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLHL28Q9NXS3 571 aa17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLHL9Q9P2J3 617 aa17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 NDRG3Q9UGV2 375 aa17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF232Q9UNY5 417 aa17.4■□□□□ 0.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBP2O00757 339 aa17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 FRS3O43559 492 aa17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 GOSR1O95249 250 aa17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 HRGP04196 525 aa17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 YES1P07947 543 aa17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 MDH1P40925 334 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 MTPNP58546 118 aa17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 NFYCQ13952 458 aa17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 WBP2NLQ6ICG8 309 aa17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 STAC2Q6ZMT1 411 aa17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 STK32CQ86UX6 486 aa17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 COMTD1Q86VU5 262 aa17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDC20BQ86Y33 519 aa17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 LURAP1LQ8IV03 231 aa17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 CADM2Q8N3J6 435 aa17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLHL4Q9C0H6 718 aa17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARMC7Q9H6L4 198 aa17.39■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 ENO4A6NNW6 628 aa17.38■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF814B7Z6K7 855 aa17.38■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP8B1O43520 1251 aa17.38■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNPH1O43598 174 aa17.38■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRKAR1BP31321 381 aa17.38■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 POU4F3Q15319 338 aa17.38■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 BEND4Q6ZU67 534 aa17.38■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 C22orf34Q6ZV56 151 aa17.38■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTOV1Q86YD1 416 aa17.38■□□□□ 0.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC35B4Q969S0 331 aa17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms