RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325438.12

PACS2-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS2, Length 3,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2-201ENST00000325438 IGF2P01344 180 aa22.19■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 PPP3CBP16298 524 aa22.19■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 ELOA3BQ3SY89 546 aa22.19■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 DEFB134Q4QY38 66 aa22.19■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa22.19■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 KRT77Q7Z794 578 aa22.19■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 TMEFF1Q8IYR6 380 aa22.19■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 ELOA3Q8NG57 546 aa22.19■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 SLC38A3Q99624 504 aa22.19■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa22.19■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 DUXAA6NLW8 204 aa22.18■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 AIFM1O95831 613 aa22.18■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 SKP1P63208 163 aa22.18■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 FAM69AQ5T7M9 428 aa22.18■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 TPGS2Q68CL5 300 aa22.18■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 IRF7Q92985 503 aa22.18■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 SGPP1Q9BX95 441 aa22.18■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 SEC16AO15027 2179 aa22.18■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 PTPRDP23468 1912 aa22.18■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 SERTM1A2A2V5 107 aa22.18■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 ADAMTS4O75173 837 aa22.18■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 SC5DO75845 299 aa22.18■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 NAGAP17050 411 aa22.18■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 ITPKBP27987 946 aa22.18■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa22.18■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 SPAG16Q8N0X2 631 aa22.18■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 OR1A2Q9Y585 309 aa22.18■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.18■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 IDSB3KWA1 339 aa22.18■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 WASH3PC4AMC7 463 aa22.18■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 FARS2O95363 451 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 RLN2P04090 185 aa22.18■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 BTCP35070 178 aa22.18■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 ZP1P60852 638 aa22.18■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 SLC6A19Q695T7 634 aa22.18■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 PTCHD1Q96NR3 888 aa22.18■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 TRAPPC13A5PLN9 417 aa22.17■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 D6RAR5 112 aa22.17■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 ATG12O94817 140 aa22.17■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 RAB3AP20336 220 aa22.17■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 CAP1Q01518 475 aa22.17■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 TRAM1Q15629 374 aa22.17■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 NKPD1Q17RQ9 610 aa22.17■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 CPNE7Q9UBL6 633 aa22.17■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 MCRIP1C9JLW8 97 aa22.17■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 NPC1O15118 1278 aa22.17■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 CBR1P16152 277 aa22.17■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 LUMP51884 338 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 NRG3P56975 720 aa22.17■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 CCDC36Q8IYA8 594 aa22.17■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 OR6V1Q8N148 313 aa22.17■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 CPXM2Q8N436 756 aa22.17■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 VN1R2Q8NFZ6 395 aa22.17■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 SLC38A1Q9H2H9 487 aa22.17■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 FANCFQ9NPI8 374 aa22.17■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 OR2S2Q9NQN1 319 aa22.17■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa22.17■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.142e-7■■■■■ 64.9
PACS2-201ENST00000325438 MMP15P51511 669 aa22.17■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 THSD4Q6ZMP0 1018 aa22.17■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 TMEM17Q86X19 198 aa22.17■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa22.17■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 GLS2Q9UI32 602 aa22.17■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 A0A1W2PR48 441 aa22.16■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 TBC1D3BA6NDS4 549 aa22.16■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 NMBP08949 121 aa22.16■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 SCRN3Q0VDG4 424 aa22.16■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 RPE65Q16518 533 aa22.16■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 IGSF11Q5DX21 431 aa22.16■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 UQCC2Q9BRT2 126 aa22.16■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 ZNF304Q9HCX3 659 aa22.16■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 IL20Q9NYY1 176 aa22.16■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 KIF25Q9UIL4 384 aa22.16■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 ICKQ9UPZ9 632 aa22.16■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa22.16■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 C5orf51A6NDU8 294 aa22.16■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 FAM74A7A6NL05 159 aa22.16■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 F8W036 122 aa22.16■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 CCSO14618 274 aa22.16■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 SIRPAP78324 504 aa22.16■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 BLOC1S1P78537 153 aa22.16■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 MAPK14Q16539 360 aa22.16■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 FAM74A3Q4VXF1 159 aa22.16■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 RNLSQ5VYX0 342 aa22.16■■□□□ 1.14
PACS2-201ENST00000325438 IL17RCQ8NAC3 791 aa22.16■■□□□ 1.14
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