RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 LPAR4Q99677 370 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 C12orf10Q9HB07 376 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 RIIAD1A6NNX1 92 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 PRR33A8MZF0 331 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 HCRTR2O43614 444 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 GDF9O60383 454 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 OR7A10O76100 309 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 NDUFB2O95178 105 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 TGFBR1P36897 503 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 ENTPD1P49961 510 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 LIMK1P53667 647 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 MC2RQ01718 297 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP24.5■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 MOGQ16653 247 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF318Q5VUA4 2279 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 FADS1O60427 444 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 INHBBP09529 407 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 PEPDP12955 493 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 SLC1A3P43003 542 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 PLA2G2CQ5R387 149 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 SHFQ7M4L6 423 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF563Q8TA94 476 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 OTULINQ96BN8 352 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 DCSTAMPQ9H295 470 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 WDR54Q9H977 334 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF337Q9Y3M9 751 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF28P17035 718 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 EVI2BP34910 448 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 WNT4P56705 351 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 TUBA1BP68363 451 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 USP43Q70EL4 1123 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 TUBA1AQ71U36 451 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 ZBTB46Q86UZ6 589 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 FBXO8Q9NRD0 319 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 OSGIN1Q9UJX0 560 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 NADKO95544 446 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 CCL4P13236 92 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 HK1P19367 917 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 SOX3P41225 446 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 SERPINB10P48595 397 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 EFR3AQ14156 821 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 LRRC17Q8N6Y2 441 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 OR4F15Q8NGB8 312 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF524Q96C55 264 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 KLHDC3Q9BQ90 382 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 MED20Q9H944 212 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 LRRN3E7EW58 273 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 FLRT2O43155 660 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 IGHA1P01876 353 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 LIMS3P0CW19 117 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 LIMS4P0CW20 117 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF3P17036 446 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 NUBP1P53384 320 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 ARMC4Q5T2S8 1044 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 KBTBD8Q8NFY9 601 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 OR8K3Q8NH51 312 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 RHBDD1Q8TEB9 315 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 LRFN5Q96NI6 719 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 JAM3Q9BX67 310 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 ADAM19Q9H013 955 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 PLGRKTQ9HBL7 147 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 CACNA1HO95180 2353 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 LNP1A1A4G5 178 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 IFNGP01579 166 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 ITGADQ13349 1161 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 TMED1Q13445 227 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 ADCK1Q86TW2 530 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 SLC37A3Q8NCC5 494 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 PSD4Q8NDX1 1056 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 NACC2Q96BF6 587 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 HCAR1Q9BXC0 346 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 CHRNA9Q9UGM1 479 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 SCO2O43819 266 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 TACR3P29371 465 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 NOS3P29474 1203 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 SLC26A5P58743 744 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 FCRLBQ6BAA4 426 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 LINC00299Q6ZSB3 139 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 OR5M3Q8NGP4 307 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 OR5W2Q8NH69 310 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 LIPHQ8WWY8 451 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 CENPOQ9BU64 300 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 ISYNA1Q9NPH2 558 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD8-201ENST00000313173 NDUFB11Q9NX14 153 aa24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms