RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000310418.8

CLTB-201, Transcript of clathrin light chain B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLTB, Length 1,215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTB-201ENST00000310418 HMGN4O00479 90 aa20.06■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 PMS2P2O95744 297 aa20.06■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 C1QCP02747 245 aa20.06■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 CDKN1AP38936 164 aa20.06■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 NME5P56597 212 aa20.06■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 PLAURQ03405 335 aa20.06■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 VEZF1Q14119 521 aa20.06■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 CSPG4Q6UVK1 2322 aa20.06■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 SSX8Q7RTT4 187 aa20.06■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 P2RY8Q86VZ1 359 aa20.06■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 RNF130Q86XS8 419 aa20.06■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 ARL5BQ96KC2 179 aa20.06■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 TEX37Q96LM6 180 aa20.06■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 PARD6BQ9BYG5 372 aa20.06■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 LIPT1Q9Y234 373 aa20.06■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa20.06■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 RAMP1O60894 148 aa20.05■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 PGM3O95394 542 aa20.05■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 IGHV3-9P01782 118 aa20.05■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 IDH2P48735 452 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 UFM1P61960 85 aa20.05■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 FAPQ12884 760 aa20.05■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 ETFDHQ16134 617 aa20.05■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 PGGHGQ32M88 737 aa20.05■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 CEP85LQ5SZL2 805 aa20.05■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 FBXW9Q5XUX1 488 aa20.05■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 OGFOD2Q6N063 350 aa20.05■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 PRIMA1Q86XR5 153 aa20.05■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 ADGRG3Q86Y34 549 aa20.05■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 UBE2J2Q8N2K1 259 aa20.05■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 ZBTB9Q96C00 473 aa20.05■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 OR11A1Q9GZK7 315 aa20.05■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 NPAP1Q9NZP6 1156 aa20.05■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 CCDC154A6NI56 674 aa20.04■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 OR5H1A6NKK0 313 aa20.04■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 DNPH1O43598 174 aa20.04■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 ADAM11O75078 769 aa20.04■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 CCNA2P20248 432 aa20.04■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 IDUAP35475 653 aa20.04■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 CLK1P49759 484 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 BST1Q10588 318 aa20.04■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 SYPL1Q16563 259 aa20.04■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa20.04■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 TRIML2Q8N7C3 387 aa20.04■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 ANKFN1Q8N957 763 aa20.04■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 PIGXQ8TBF5 258 aa20.04■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 APH1AQ96BI3 265 aa20.04■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 PANX1Q96RD7 426 aa20.04■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 AIG1Q9NVV5 245 aa20.04■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 JMJD1CQ15652 2540 aa20.03■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 SHISA9B4DS77 424 aa20.03■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 RNF223E7ERA6 249 aa20.03■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 AP3D1O14617 1153 aa20.03■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 GPR171O14626 319 aa20.03■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 ABCD4O14678 606 aa20.03■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 RAD51DO75771 328 aa20.03■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 HTR3AP46098 478 aa20.03■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 CDH11P55287 796 aa20.03■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 OR2B6P58173 313 aa20.03■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 CMIPQ8IY22 773 aa20.03■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 INPP5KQ9BT40 448 aa20.03■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 SLC38A1Q9H2H9 487 aa20.03■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 ALG2Q9H553 416 aa20.03■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 TMEM181Q9P2C4 612 aa20.03■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa20.02■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 CIB4A0PJX0 185 aa20.02■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 AGAP5A6NIR3 686 aa20.02■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 CCT8L1PA6NM43 557 aa20.02■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 SDHDO14521 159 aa20.02■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 PGRP06401 933 aa20.02■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 CHRM4P08173 479 aa20.02■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 IL12AP29459 219 aa20.02■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 NTF4P34130 210 aa20.02■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 CDKN2CP42773 168 aa20.02■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 SLC16A1P53985 500 aa20.02■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa20.02■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 ZNF621Q6ZSS3 439 aa20.02■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 SPATA19Q7Z5L4 167 aa20.02■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 CCDC103Q8IW40 242 aa20.02■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa20.02■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 OR52E6Q96RD3 313 aa20.02■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa20.02■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 FAIMQ9NVQ4 179 aa20.02■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 ASB6Q9NWX5 421 aa20.02■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 TRAPPC4Q9Y296 219 aa20.02■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 TMED7Q9Y3B3 224 aa20.02■□□□□ 0.8
CLTB-201ENST00000310418 CADP27708 2225 aa20.02■□□□□ 0.79
CLTB-201ENST00000310418 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms