RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 ENTPD8Q5MY95 495 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 RTL6Q6ICC9 239 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 CYP2R1Q6VVX0 501 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 RPTNQ6XPR3 784 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 DEF8Q6ZN54 512 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 ZPLD1Q8TCW7 415 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 MCUR1Q96AQ8 359 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 MEMO1Q9Y316 297 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 FAM215AQ9Y5M1 114 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 V9GYQ6 96 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 A0A0J9YW62 118 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 CLCA1A8K7I4 914 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 E9PLN8 166 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 FMO6PO60774 539 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 SGCBQ16585 318 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 IFI44LQ53G44 452 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 SYT14P1Q58G82 188 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 ALG10BQ5I7T1 473 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 OR5B2Q96R09 309 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 VKORC1Q9BQB6 163 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 SELENONQ9NZV5 590 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 ACTR3BQ9P1U1 418 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 SLC5A6Q9Y289 635 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 A0A1W2PNR3 127 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM72A0PK05 275 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 GSC2O15499 205 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 ELOA3BQ3SY89 546 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 PDSS1Q5T2R2 415 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 HBMQ6B0K9 141 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 PPP4R4Q6NUP7 873 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 ULK3Q6PHR2 472 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 PLXDC2Q6UX71 529 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 DHFR2Q86XF0 187 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 ELOA3Q8NG57 546 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 OR10D3Q8NH80 312 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 OR2V1Q8NHB1 315 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 DNAJA3Q96EY1 480 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 ADGRG7Q96K78 797 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 OR11A1Q9GZK7 315 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 MUC13Q9H3R2 512 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 A0A0B4J2E0 115 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 A0A1B0GX12 115 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 ADAMDEC1O15204 470 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 CXCL13O43927 109 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 SEMA7AO75326 666 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 PRKD3O94806 890 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 IFNW1P05000 195 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 ATP6V1B2P21281 511 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 MS4A2Q01362 244 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 KCNC4Q03721 635 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 FAM86B1Q8N7N1 296 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 DDIT4LQ96D03 193 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 ASB9Q96DX5 294 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF208O43345 1280 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 STAMBPO95630 424 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 CDH12P55289 794 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 CARD18P57730 90 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 PMPCAQ10713 525 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF613Q6PF04 617 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 MARVELD2Q8N4S9 558 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 OSTF1Q92882 214 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 SLC47A1Q96FL8 570 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 ARL5BQ96KC2 179 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 DMRTA2Q96SC8 542 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 TTYH2Q9BSA4 534 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 COQ10BQ9H8M1 238 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 PNMTP11086 282 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 MAP2K6P52564 334 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 NUP107P57740 925 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 TAS2R41P59536 307 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 PON3Q15166 354 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM211Q6ICI0 200 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 PGM2L1Q6PCE3 622 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC120Q96HB5 630 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 LRMDAQ9H2I8 198 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXD4-201ENST00000306324 CALHM2Q9HA72 323 aa20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.5 ms