RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264346.11

HERC6-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 6, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC6, Length 3,779 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6-201ENST00000264346 SIGIRRQ6IA17 410 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 JAGN1Q8N5M9 183 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 OR13C5Q8NGS8 318 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 OR51Q1Q8NH59 317 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 ASB15Q8WXK1 588 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 CDCA4Q9BXL8 241 aa11.63□□□□□ -0.55
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HERC6-201ENST00000264346 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
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HERC6-201ENST00000264346 THAP4Q8WY91 577 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 C20orf141Q9NUB4 165 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 GMEB2Q9UKD1 530 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 H3BML4 177 aa11.63□□□□□ -0.55
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HERC6-201ENST00000264346 CD79BP40259 229 aa11.63□□□□□ -0.55
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HERC6-201ENST00000264346 ZNF627Q7L945 461 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 NAXEQ8NCW5 288 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 RASD2Q96D21 266 aa11.63□□□□□ -0.55
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HERC6-201ENST00000264346 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa11.63□□□□□ -0.55
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HERC6-201ENST00000264346 LPAL2Q16609 132 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 C1orf94Q6P1W5 598 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 NUP54Q7Z3B4 507 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 KDM8Q8N371 416 aa11.62□□□□□ -0.55
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HERC6-201ENST00000264346 OR8D4Q8NGM9 314 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 GHSRQ92847 366 aa11.62□□□□□ -0.55
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HERC6-201ENST00000264346 FBXL4Q9UKA2 621 aa11.62□□□□□ -0.55
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HERC6-201ENST00000264346 ZNF879B4DU55 563 aa11.62□□□□□ -0.55
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HERC6-201ENST00000264346 DSCR3O14972 297 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 OR8G3PP0DMU2 310 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 NID1P14543 1247 aa11.62□□□□□ -0.55
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HERC6-201ENST00000264346 GDI2P50395 445 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 AKR1D1P51857 326 aa11.62□□□□□ -0.55
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HERC6-201ENST00000264346 P2RX3P56373 397 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP11.62□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 NTRK2Q16620 822 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 C3orf38Q5JPI3 329 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 ZNF620Q6ZNG0 422 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 FCRL1Q96LA6 429 aa11.62□□□□□ -0.55
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HERC6-201ENST00000264346 FAM60AQ9NP50 221 aa11.62□□□□□ -0.55
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HERC6-201ENST00000264346 FBXO8Q9NRD0 319 aa11.62□□□□□ -0.55
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HERC6-201ENST00000264346 EFEMP2O95967 443 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 AK1P00568 194 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 TACSTD2P09758 323 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 FPR3P25089 353 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 RPS5P46782 204 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 BAK1Q16611 211 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 OR6C4Q8NGE1 309 aa11.62□□□□□ -0.55
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