RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 ST6GAL1P15907 406 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 SDHBP21912 280 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 TACR3P29371 465 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 SLC1A3P43003 542 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 SLC6A12P48065 614 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 ADPRHP54922 357 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 ACTA2P62736 377 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 VAMP2P63027 116 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 ACTG2P63267 376 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 MELKQ14680 651 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 VWA2Q5GFL6 755 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 FAM205BPQ63HN1 556 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 TMEM215Q68D42 235 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 SLC6A19Q695T7 634 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 SLC18B1Q6NT16 456 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 TCTN3Q6NUS6 607 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 CCDC36Q8IYA8 594 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 AMER3Q8N944 861 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 TMEM163Q8TC26 289 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 MUL1Q969V5 352 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 ORAI1Q96D31 301 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 NEURL3Q96EH8 262 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 TSSK2Q96PF2 358 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 ULBP3Q9BZM4 244 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 MCOLN1Q9GZU1 580 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 UBQLN3Q9H347 655 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 ZNF442Q9H7R0 627 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 INIPQ9NRY2 104 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 ACER3Q9NUN7 267 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 TBCCD1Q9NVR7 557 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 ALG5Q9Y673 324 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 RNF215Q9Y6U7 377 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 CREBBPQ92793 2442 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 MED13LQ71F56 2210 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 SULT2B1O00204 365 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 SLC19A2O60779 497 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 HTR3BO95264 441 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 AMY2BP19961 511 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 GNRHRP30968 328 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 PRSS3P35030 304 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 IDUAP35475 653 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 ALDH3B2P48448 385 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 EPHA5P54756 1037 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 HERV-K104P61576 105 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 BTG2P78543 158 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 PLP2Q04941 152 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 RAB40BQ12829 278 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 TATDN3Q17R31 274 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 COL28A1Q2UY09 1125 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 SLC48A1Q6P1K1 146 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 LRRN1Q6UXK5 716 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 MED25Q71SY5 747 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 LINC00346Q8IVM7 164 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 BATF2Q8N1L9 274 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 ZNF565Q8N9K5 539 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 OR5L2Q8NGL0 311 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 PFN4Q8NHR9 129 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 FAM174AQ8TBP5 190 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 RASD2Q96D21 266 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 ZG16BQ96DA0 208 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 ELMOD3Q96FG2 381 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 SFXN2Q96NB2 322 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 PKMYT1Q99640 499 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 EMC6Q9BV81 110 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 POTEKPQ9BYX7 375 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 ELOVL3Q9HB03 270 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 HHATLQ9HCP6 504 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 UBQLN4Q9NRR5 601 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 CUTCQ9NTM9 273 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 SAGE1Q9NXZ1 904 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 REV1Q9UBZ9 1251 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 OSGIN1Q9UJX0 560 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 RCE1Q9Y256 329 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 CORINQ9Y5Q5 1042 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 NOX1Q9Y5S8 564 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 COL6A6A6NMZ7 2263 aa5.12□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 POM121CA8CG34 1229 aa5.12□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 AGPAT2O15120 278 aa5.12□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 AQP9O43315 295 aa5.12□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 FGF17O60258 216 aa5.12□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 KCNJ13O60928 360 aa5.12□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 SPDEFO95238 335 aa5.12□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 FUCA1P04066 466 aa5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms