RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229265.10

CDCA3-201, Transcript of cell division cycle associated 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDCA3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3-201ENST00000229265 C5orf46Q6UWT4 87 aa9.78□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 CCDC81Q6ZN84 652 aa9.78□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 SLC29A4Q7RTT9 530 aa9.78□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF843Q8N446 348 aa9.78□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa9.78□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 KBTBD8Q8NFY9 601 aa9.78□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 TBC1D15Q8TC07 691 aa9.78□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 TMEM255BQ8WV15 326 aa9.78□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 KCNE4Q8WWG9 221 aa9.78□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 BORCS5Q969J3 196 aa9.78□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 CNPPD1Q9BV87 410 aa9.78□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 YIPF2Q9BWQ6 316 aa9.78□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa9.78□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 NDEL1Q9GZM8 345 aa9.78□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 UBQLN3Q9H347 655 aa9.78□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 RARRES3Q9UL19 164 aa9.78□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 SIGLEC7Q9Y286 467 aa9.78□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 A0A1B0GWA3 101 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 VSTM2BA6NLU5 285 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 EFCAB9A8MZ26 197 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 BHLHE40O14503 412 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 ARPC3O15145 178 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF264O43296 627 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 AIREO43918 545 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 PRKYO43930 277 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 SOX14O95416 240 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 DDAH2O95865 285 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 IGKV1D-16P01601 117 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 INHBBP09529 407 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 FGF5P12034 268 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 IFI30P13284 250 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 MYL12AP19105 171 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 HK1P19367 917 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 HTR2AP28223 471 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 TGFBR2P37173 567 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 CLK1P49759 484 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 PGDP52209 483 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF91Q05481 1191 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 POU4F2Q12837 409 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 TPBGQ13641 420 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 EFR3AQ14156 821 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 SYT16Q17RD7 645 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 ALG10BQ5I7T1 473 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 FNDC7Q5VTL7 733 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 NPSR1Q6W5P4 371 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 OLIG3Q7RTU3 272 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF248Q8NDW4 579 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 OR5L2Q8NGL0 311 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 OR4C3Q8NH37 302 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 OR6S1Q8NH40 331 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 NUBPLQ8TB37 319 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 PRR14Q9BWN1 585 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 FAM117AQ9C073 453 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 OR52D1Q9H346 318 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 HMG20AQ9NP66 347 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 AMBNQ9NP70 447 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 FBXO8Q9NRD0 319 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 CMC2Q9NRP2 79 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 TBC1D23Q9NUY8 699 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 AASSQ9UDR5 926 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 KLHL3Q9UH77 587 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 KLHL21Q9UJP4 597 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 OSGIN1Q9UJX0 560 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 COL12A1Q99715 3063 aa9.77□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 OR6C70A6NIJ9 312 aa9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 SLC22A31A6NKX4 558 aa9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 ALG1L2C9J202 215 aa9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 K7ENP7 123 aa9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 FRS3O43559 492 aa9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 TSPAN2O60636 221 aa9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 NDUFB2O95178 105 aa9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 IFNGP01579 166 aa9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 LCKP06239 509 aa9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 GKN3PP0CG01 181 aa9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 PRG2P13727 222 aa9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 CPEP16870 476 aa9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 SLC6A6P31641 620 aa9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 LIPAP38571 399 aa9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 OR1D4P47884 311 aa9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 GAS1P54826 345 aa9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 NRG3P56975 720 aa9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 KCNAB1Q14722 419 aa9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF846Q147U1 533 aa9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms