RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623983.1

CU639417.5-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CU639417.5, Length 476 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU639417.5-201ENST00000623983 ROBO4Q8WZ75 1007 aa7.9□□□□□ -1.14
CU639417.5-201ENST00000623983 MAL2Q969L2 176 aa7.9□□□□□ -1.14
CU639417.5-201ENST00000623983 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
CU639417.5-201ENST00000623983 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
CU639417.5-201ENST00000623983 CCDC106Q9BWC9 280 aa7.9□□□□□ -1.14
CU639417.5-201ENST00000623983 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa7.9□□□□□ -1.14
CU639417.5-201ENST00000623983 SRXN1Q9BYN0 137 aa7.9□□□□□ -1.14
CU639417.5-201ENST00000623983 RAD21L1Q9H4I0 556 aa7.9□□□□□ -1.14
CU639417.5-201ENST00000623983 BCL2L10Q9HD36 194 aa7.9□□□□□ -1.14
CU639417.5-201ENST00000623983 TIGARQ9NQ88 270 aa7.9□□□□□ -1.14
CU639417.5-201ENST00000623983 CTPS2Q9NRF8 586 aa7.9□□□□□ -1.14
CU639417.5-201ENST00000623983 SERINC1Q9NRX5 453 aa7.9□□□□□ -1.14
CU639417.5-201ENST00000623983 RLIMQ9NVW2 624 aa7.9□□□□□ -1.14
CU639417.5-201ENST00000623983 CRIM1Q9NZV1 1036 aa7.9□□□□□ -1.14
CU639417.5-201ENST00000623983 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
CU639417.5-201ENST00000623983 CLEC4AQ9UMR7 237 aa7.9□□□□□ -1.14
CU639417.5-201ENST00000623983 LRBAP50851 2863 aa7.9□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 A0A1W2PNR3 127 aa7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 FAM221AA4D161 298 aa7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 CDHR4A6H8M9 788 aa7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 TMEM247A6NEH6 219 aa7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 CFAP73A6NFT4 308 aa7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 TUBAL3A6NHL2 446 aa7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 AP3D1O14617 1153 aa7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 PGM3O95394 542 aa7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 THBS1P07996 1170 aa7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 VIMP08670 466 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 GPX2P18283 190 aa7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 PPIBP23284 216 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 SLC7A1P30825 629 aa7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 CPA2P48052 419 aa7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 PCYT1AP49585 367 aa7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 FAM27E3Q08E93 113 aa7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 EPS8Q12929 822 aa7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 LIN52Q52LA3 116 aa7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 RUNDC3AQ59EK9 446 aa7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 RNF220Q5VTB9 566 aa7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 ZNF836Q6ZNA1 936 aa7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 GRINAQ7Z429 371 aa7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 RETREG3Q86VR2 466 aa7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 ADGRG3Q86Y34 549 aa7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 ZNF440Q8IYI8 595 aa7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 CLIP4Q8N3C7 705 aa7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 DPP10Q8N608 796 aa7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 ZNF610Q8N9Z0 462 aa7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 LINC01560Q8TB33 94 aa7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 FAM222BQ8WU58 562 aa7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 OR5B2Q96R09 309 aa7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 IKZF5Q9H5V7 419 aa7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 GLRX2Q9NS18 164 aa7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 CHRNA9Q9UGM1 479 aa7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 PRDM4Q9UKN5 801 aa7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 ZNF232Q9UNY5 417 aa7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 IFT52Q9Y366 437 aa7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 NDUFAF1Q9Y375 327 aa7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 EMC9Q9Y3B6 208 aa7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 CHST2Q9Y4C5 530 aa7.89□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 PDZD2O15018 2839 aa7.88□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 EVPLLA8MZ36 301 aa7.88□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 CTAG2O75638 210 aa7.88□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 PRKD3O94806 890 aa7.88□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 PLGP00747 810 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 GKN3PP0CG01 181 aa7.88□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 ARAFP10398 606 aa7.88□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 EPXP11678 715 aa7.88□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 ENPP1P22413 925 aa7.88□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 AGTR1P30556 359 aa7.88□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 CPOXP36551 454 aa7.88□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 CD79BP40259 229 aa7.88□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 MDH1P40925 334 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 SLC1A3P43003 542 aa7.88□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 HTR3AP46098 478 aa7.88□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 DIO1P49895 249 aa7.88□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 ARFIP2P53365 341 aa7.88□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 CTBP2P56545 445 aa7.88□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP7.88□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 ADRM1Q16186 407 aa7.88□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 ZSWIM7Q19AV6 140 aa7.88□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 SYT14P1Q58G82 188 aa7.88□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 GCNT6Q5T4J0 391 aa7.88□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 TMPPEQ6ZT21 453 aa7.88□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 FCRLAQ7L513 359 aa7.88□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 DHDDSQ86SQ9 333 aa7.88□□□□□ -1.15
CU639417.5-201ENST00000623983 SLC43A2Q8N370 569 aa7.88□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms