RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596332.1

LIG1-210, Transcript of DNA ligase 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIG1, Length 584 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1-210ENST00000596332 ACTR3BQ9P1U1 418 aa9.51□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 SLC7A8Q9UHI5 535 aa9.51□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 OSGIN2Q9Y236 505 aa9.51□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 SVILO95425 2214 aa9.51□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 A0A0B4J2E0 115 aa9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 A0A1B0GX12 115 aa9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 TMEM72A0PK05 275 aa9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 WIPF3A6NGB9 483 aa9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 LINC01387J3KSC0 135 aa9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 GYG2O15488 501 aa9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 FMO6PO60774 539 aa9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 FZD7O75084 574 aa9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 PRKD3O94806 890 aa9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 PEPDP12955 493 aa9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 ME2P23368 584 aa9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 ELK4P28324 431 aa9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 EIF1P41567 113 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 BNIP2Q12982 314 aa9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 ENTPD8Q5MY95 495 aa9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 WBP2NLQ6ICG8 309 aa9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 C3P1Q6ZMU1 363 aa9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 GRINAQ7Z429 371 aa9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 CD163Q86VB7 1156 aa9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 CARM1Q86X55 608 aa9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 LILRA2Q8N149 483 aa9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 ZPLD1Q8TCW7 415 aa9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 SLC38A4Q969I6 547 aa9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 SARAFQ96BY9 339 aa9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 HSH2DQ96JZ2 352 aa9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 ZNF426Q9BUY5 554 aa9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 OR11A1Q9GZK7 315 aa9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 ACAD8Q9UKU7 415 aa9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 A4GNTQ9UNA3 340 aa9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 SH3GLB1Q9Y371 365 aa9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 AP4B1Q9Y6B7 739 aa9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 GTF3C1Q12789 2109 aa9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 ZGRF1Q86YA3 2104 aa9.5□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 AHRRA9YTQ3 701 aa9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 ZNF814B7Z6K7 855 aa9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 H3BML4 177 aa9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 J3KTA2 159 aa9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 BCKDKO14874 412 aa9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 ATP5HO75947 161 aa9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 NUDT14O95848 222 aa9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 TGM6O95932 706 aa9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 IMPDH2P12268 514 aa9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 GP1BBP13224 206 aa9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 CDH12P55289 794 aa9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 ADORA2A-AS1P86434 159 aa9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 VLDLRP98155 873 aa9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 LTBQ06643 244 aa9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 MERTKQ12866 999 aa9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 CDSNQ15517 529 aa9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 DNAL1Q4LDG9 190 aa9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 CYP2R1Q6VVX0 501 aa9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 ZNF563Q8TA94 476 aa9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 RASSF5Q8WWW0 418 aa9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 TMEM234Q8WY98 164 aa9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 ASB9Q96DX5 294 aa9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 PYURFQ96I23 114 aa9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 MCHR1Q99705 422 aa9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 ZNF559Q9BR84 538 aa9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 FUZQ9BT04 418 aa9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 PTDSS2Q9BVG9 487 aa9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 SRXN1Q9BYN0 137 aa9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 TRIM2Q9C040 744 aa9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 TMEM185BQ9H7F4 350 aa9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 EVA1AQ9H8M9 152 aa9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 NDUFAF4Q9P032 175 aa9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 CLCF1Q9UBD9 225 aa9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 CHRNA9Q9UGM1 479 aa9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 BAG5Q9UL15 447 aa9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 POMPQ9Y244 141 aa9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 MEMO1Q9Y316 297 aa9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 TMED7Q9Y3B3 224 aa9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 MYO18BQ8IUG5 2567 aa9.49□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 A0A087WUJ7 227 aa9.48□□□□□ -0.89
LIG1-210ENST00000596332 A0A1W2PNR3 127 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.4 ms