RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587769.1

CTIF-204, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 4

Gene CTIF, Length 547 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-204ENST00000587769 RRP9O43818 475 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 ZIC3O60481 467 aa9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 TPST2O60704 377 aa9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 NTN1O95631 604 aa9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 GPIP06744 558 aa9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 RNF224P0DH78 156 aa9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 ADH6P28332 368 aa9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 SLC1A3P43003 542 aa9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 HTR3AP46098 478 aa9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 TDGF1P3P51864 188 aa9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 B3GALT5-AS1P59052 145 aa9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 TAS2R41P59536 307 aa9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 MERTKQ12866 999 aa9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 SELENBP1Q13228 472 aa9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 TMEM44Q2T9K0 475 aa9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 SLC25A53Q5H9E4 307 aa9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 AAGABQ6PD74 315 aa9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 ADGRG5Q8IZF4 528 aa9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 GHDCQ8N2G8 530 aa9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 LSMEM1Q8N8F7 131 aa9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 OR5M1Q8NGP8 315 aa9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 NEIL3Q8TAT5 605 aa9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 POC1BQ8TC44 478 aa9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 C3orf49Q96BT1 292 aa9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 ZNF524Q96C55 264 aa9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 PRRC1Q96M27 445 aa9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 SEPHS2Q99611 448 aa9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 NPAS1Q99742 590 aa9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 UGT2B28Q9BY64 529 aa9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 MAGIXQ9H6Y5 334 aa9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 TMEM27Q9HBJ8 222 aa9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 CTPS2Q9NRF8 586 aa9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 PLSCR2Q9NRY7 297 aa9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 SELENONQ9NZV5 590 aa9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 PRDM4Q9UKN5 801 aa9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 SLC6A5Q9Y345 797 aa9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 ENPP4Q9Y6X5 453 aa9.81□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 MAST4O15021 2626 aa9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 LINC01387J3KSC0 135 aa9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 hCG_2039718K7EN88 272 aa9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 AQP7O14520 342 aa9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 SUSD5O60279 629 aa9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 OR5F1O95221 314 aa9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 FABP3P05413 133 aa9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 UMPSP11172 480 aa9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 ITGA2P17301 1181 aa9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 TACR3P29371 465 aa9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 MAGEA2P43356 314 aa9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 ERFP50548 548 aa9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 GFRA1P56159 465 aa9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 VLDLRP98155 873 aa9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 CHRNB3Q05901 458 aa9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 CCNIQ14094 377 aa9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 OR1Q1Q15612 314 aa9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 KRTCAP3Q53RY4 240 aa9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 ALG10BQ5I7T1 473 aa9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 ENTPD8Q5MY95 495 aa9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 C3orf33Q6P1S2 294 aa9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 ZNF613Q6PF04 617 aa9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 CYP4Z1Q86W10 505 aa9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 OFCC1Q8IZS5 231 aa9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 SSC4DQ8WTU2 575 aa9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 PRR14Q9BWN1 585 aa9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 C12orf10Q9HB07 376 aa9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 SPRR3Q9UBC9 169 aa9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 CHRNA9Q9UGM1 479 aa9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 AURKCQ9UQB9 309 aa9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 PCNX3Q9H6A9 2034 aa9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 PKDREJQ9NTG1 2253 aa9.8□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 A0A1B0GVC2 190 aa9.79□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 TRAPPC13A5PLN9 417 aa9.79□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 WIPF3A6NGB9 483 aa9.79□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 H3BML4 177 aa9.79□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 CHP2O43745 196 aa9.79□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 ACTL6AO96019 429 aa9.79□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 RAP2AP10114 183 aa9.79□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 EDN3P14138 238 aa9.79□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 CHMP24386 653 aa9.79□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 IFNA8P32881 189 aa9.79□□□□□ -0.84
CTIF-204ENST00000587769 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.4 ms